Токовая отсечка и мтз в чем разница: Токовая отсечка и максимальная токовая защита

Токовая отсечка и максимальная токовая защита

Не все понимают отличия между токовой отсечкой и максимальной токовой защитой, которые в большинстве источников для краткости обозначаются аббревиатурами ТО (не путать с техническим обслуживанием) и МТЗ. И это объяснимо, так как и отсечка, и максимальная защита выполняют одну и ту же функцию – предохранение эл/цепи, ее элементов и присоединенных устройств от разрушения (выхода из строя).

Так в чем их смысл и есть ли какая-то разница между ними? С этим мы и разберемся.

При написании данной статьи автор изучил различные источники и пришел к выводу, что по этому вопросу очень много путаницы. Именно поэтому он рекомендует  в первую очередь обратиться к основополагающему документу – ПУЭ (3.2.) . А весь остальной материал, встречающийся в интернете, следует рассматривать лишь как пояснения (разъяснения) к положениям правил. Причем нужно относиться к этой информации критически, сопоставляя ее с тем, что прописано (хотя и несколько «скуповато»), в ПУЭ.

По принципу действия максимальная токовая защита и отсечка идентичны. Элементы, их обеспечивающие, реагируют на один и тот же параметр электрической цепи – ток, точнее, на его величину. При превышении им определенного, заданного значения (уставки) защитное устройство срабатывает. Разница в том, как именно?

Ток, протекающий по проводникам (а они характеризуются своим удельным сопротивлением, в зависимости от материала – алюминий или медь) приводит к их нагреву. И чем выше его значение, тем сильнее. При повреждениях изоляции и коротких замыканиях данный параметр может вырасти резко и достигать большой величины. Результат вполне прогнозируем. Кстати, это одна из основных причин, если верить статистике, всех воспламенений в электрифицированных зданиях и сооружениях.

Именно поэтому для каждой электрической цепи предусматривается свой номинал тока, при превышении которого цепь должна разрываться. В этом – смысл любой защиты данного типа.  Многое зависит от того, где именно произошло повреждение. В силу удельного сопротивления металлов быстрее среагирует то устройство, которое расположено ближе к «аварийной зоне». Многое зависит и от электрической схемы. Если она сложная, то в ней предусматривается несколько защитных автоматов – общий и на каждой «нитке» (также прописано в ПУЭ).

С учетом множественности вариантов проектирования электрических цепей однозначно сказать, в чем принципиальная разница между токовой отсечкой и МТЗ, нельзя. Все зависит от характеристик схемы и места расположения в ней того или иного защитного изделия. Если суммировать всю информацию по ТО и МТЗ, то можно сделать следующие выводы.

• Селективности (синоним слова избирательность) обеспечиваются: МТЗ – задержкой срабатывания (выдержкой времени), ТО – отстройкой по номиналу тока. Яркий пример – УЗО. Но это не обязательное условие, так как если на линии лишь 1 автомат, причем одноступенчатый, то задержки времени быть не должно.
• Максимальная токовая защита является основной. При включении в цепь дифференциального устройства она переходит в категорию резервной. ТО используется лишь как дополнительная функция предохранения линии и оборудования. Более подробно об этом можно узнать в ПУЭ 3.2.16 (26).
• Токовая отсечка – разновидность МТЗ, только с ограниченным «радиусом действия».

Все остальные суждения по данному вопросу (например, что ТО является основным видом защиты) – не более чем выдумки, вызванные малой осведомленностью тех, кто делает подобные заявления.

Автор будет рад, если статья поможет читателю понять, в чем разница между токовой отсечкой и максимальной защитой.

МТЗ и ТО — особенности терминологии (Страница 8) — Студенческий Раздел — Советы бывалого релейщика

А я в Чернобровове вычитал такой догмат — что токовая отсечка отличается от максимальной токовой защиты по условию селективности. У первой селективность по току, а у второй по времени.
Таким образом, получается, что когда короткое замыкание заставляет работать защиту без выдержки времени, то это токовая отсечка, а вот когда уже проходит выставленное время, то это МТЗ.
Но где-то ещё было написано, что у токовой отсечки несколько ступеней. Что вот есть без выдержки времени и с выдержкой.
Но ведь когда проходит время, то это уже как бы МТЗ.
С другой стороны, если у нас есть, например, цех с двигателями, то при пуске у двигателей пусковой ток, которым двигатели дербанят сеть. А это значит, что защиту нужно отстроить от пускового тока, иначе она будет каждый раз срабатывать. Можно дать выдержку времени, чтобы ток, смахивающий размерами на кз, был как бы неустойчивым во времени и не вызывал срабатывания защит, а вот если кто-нибудь уронит лом на шины и лом останется — то всё отключится. Можно дать отстройку по току, но тогда отсечка будет фригидной.
Если давать выдержку времени ТО, то будет ли она МТЗ? Будет ли это ТО, отстроенная по времени, чтобы не потерять чувствительности по току? Или таки МТЗ? Но ведь за время отстройки ток успеет повыситься до предела, при котором сработала бы ТО, где уставка на, положим, 12 ном, а при пуске от одного двигателя на 5 ном. Значит не такая уж и фригидная эта ТО. Но вообще, желательно чтобы она работала и при 5ном, чтобы оборудование не портилось, значит нужно что-то сделать с двигателями, чтобы они не дербанили сеть. Например, подключать их к сети только после подтверждения нормального режима работы, а запускать конденсаторной батареей; или использовать резисторы. Тогда можно и отсечку сделать нормальной, а не дурашливой.
Вот что такое ТО с выдержкой времени — это ТО с отстройкой от других защит или отстройкой от параметров «нормального режима работы» сети (или как назвать включение двигателей) или вообще с временным подтверждением устойчивости аварийного режима в сети? Просто если последнее, то это МТЗ. Тот же перегруз — это может быть нагрузка на не так уж и много процентов от номинальной, но длительно, а значит нехорошо и надо это дело отключить. И перегруз это точно не ТО. А ещё с подтверждением устойчивости замыкания справляется АПВ.
Но если есть с выдержкой времени, то разве должна быть без выдержки? Значит должна быть железно: либо ТО без выдержки, МТЗ 1, МТЗ 2 и т. д. Либо МТЗ 1, МТЗ 2 и т.д. То есть характеристика либо вида гладкой линии, либо линии с одним обрубом. Но ведь есть характеристика с двумя обрубами, причём первая пологая линия у нуля, вторая у значения, а третья линия не пологая, а увеличивающаяся, как независимая характеристика. Первую ступень можно блокировать многими защитами, вторую блокировать поменьше. Тогда это обретает смысл.

Токовая защита релейной защиты промышленных и гражданских зданий | Росподільні мережі

Для защиты от междуфазных коротких замыканий широко применяют максимальные токовые защиты и токовые отсечки. Их используют также для защиты от однофазных замыканий на землю.

Максимальной токовой защитой называют защиту, действующую в случаях, когда ток в защищаемой цепи превышает значение, равное максимальному рабочему току этой цепи. Такая защита является наиболее надежной, дешевой и простой по выполнению. Ее применяют для защиты кабельных и воздушных линий при одностороннем их питании, генераторов, трансформаторов, высоковольтных электродвигателей.

Максимальная токовая защита относится к защитам с выдержкой времени. Ее обычно выполняют с помощью электромагнитных реле максимального тока и реле времени.

На рис. 1, а показана принципиальная однолинейная схема максимальной защиты, выполненной с помощью электромагнитного реле максимального тока КА и реле времени КГ. В нормальном режиме работы защищаемого звена контакты реле КА и КГ разомкнуты. При увеличении тока в обмотке реле КА до определенного значения /с 3 (ток срабатывания защиты) оно срабатывает и замыкает своими контактами цепь обмотки реле времени КТ. Последнее приходит в действие и через заданную выдержку времени замыкает контактами цепь постоянного тока отключающей катушки YAТ привода выключателя QF. В результате выключатель отключается. В оперативной цепи постоянного тока находятся блок- контакты SQ привода выключателя QF. Если бы этих блок-контактов не было, контакты реле КТ размыкались бы при наличии тока в цепи отключающей катушки привода, вследствие чего могли бы быть повреждены из- за недостаточной мощности на размыкание.

а                       б

Рис. 1. Принципиальная однолинейная схема (а) и характеристика (б) максимальной токовой защиты с независимой выдержкой времени

Время действия защиты /3 (рис. 1, б) зависит от времени срабатывания реле КТ и не зависит от тока в обмотке токового реле КА, поэтому такую защиту называют защитой с независимой выдержкой времени.

Указательное реле КИ является вспомогательным и служит для сигнализации срабатывания реле.

В радиальных сетях с односторонним питанием максимальную токовую защиту выполняют с питающей стороны каждой линии. При этом для обеспечения селективности отключения выдержку времени защиты подбирают по ступенчатому принципу, согласно которому у каждой последующей защиты, считая по направлению к источнику питания, выдержку времени принимают на ступень времени больше, чем у предыдущей.

Рассмотрим пример выполнения защиты от однофазного короткого замыкания на землю кабельной сети напряжением 6(10) кВ с заземленной нейтралью (рис. 2). Действие защиты основано на том, что в нормальном режиме суммарный поток, создаваемый трехфазной системой токов в жилах кабеля, равен нулю. При замыкании на землю одной из фаз / кабеля симметрия токов нарушается и возникает магнитный поток в магнитопроводе 4, который наводит ЭДС в обмотке 3 трансформатора тока ТА. В результате в цепи реле КА появляется ток и реле срабатывает.

Токовая отсечка может быть быстродействующей или с выдержкой времени (0,5… 1 с). В отличие от максимальной токовой защиты отсечка заранее ограничивается зоной действия. Это делается для обеспечения селективности (избирательности действия), которая достигается путем выбора тока срабатывания отсечки, а не выдержки времени, как при максимальной токовой защите.

Известно, что ток короткого замыкания в линии (рис. 3, а) определяется значением сопротивления от источника питания до места повреждения и уменьшается с удалением последнего, о чем свидетельствует кривая на рис. 3, б. Наименьший ток короткого замыкания возникает при повреждении в конце линии (в точке К1), а наибольший — в ее начале (в точке КЗ). Токовое реле КА отсечки отстраивают от тока короткого замыкания /  которой численно равен току короткого замыкания при повреждении в точке К2.

Рис. 2. Выполнение защиты от замыкания на землю в кабельной сети:

а — общий вид кабельной сети с трансформатором тока: б — схема действия защиты; 1 — фазы кабеля; 2 — кронштейн крепления трансформатора тока; 3 обмотка; 4 — магнитопровол

При токе срабатывания /сотс токовая отсечка действует только при коротком замыкании на отрезке JI1, а и не действует на отрезке Л1, б участка Л1 линии, а также вне этого участка, например на сборных шинах или на участке Л2 линии. Следовательно, токовая отсечка защищает не всю, а только часть линии. Токовую отсечку выполняют по схеме максимальной токовой защиты, но делают быстродействующей, т. е. без выдержки времени (рис. 4).

Рис. 3. Принципиальная схема линии (а) и характеристики (б), поясняющие принцип действия токовой отсечки с односторонним питанием

Рис. 4. Принципиальная схема защиты линии от междуфазных коротких замыканий (токовая отсечка без выдержки времени)

Для защиты участка Л2 (см. рис. 3, б) на линии со стороны питания устанавливают дополнительную защиту, в качестве которой может быть выбрана, например, максимальная токовая защита с выдержкой времени или с пуском от реле минимального напряжения.

Избирательность максимальной токовой защиты обеспечивается только в радиальных сетях с односторонним питанием, в то время как токовая отсечка может применяться в сети любой конфигурации с любым источником питания. Существенным недостатком токовой отсечки без выдержки времени является то, что она защищает только часть линии, а поэтому не может служить основной защитой линии.

Максимальная токовая защита, токовая отсечка, назначение, принцип работы, отличия

МТЗ (максимальная токовая защита)

МТЗ относится к разряду токовых защит, реагирующих на повышение тока в контролируемой цепи до некоторого расчетного уровня — тока срабатывания защиты 1с. з.

Применяется для защиты электрооборудования и электросети от токов короткого замыкания и токов перегрузки.

МТЗ всегда состоит из пускового органа, который выявляет момент КЗ или перегрузки линии (например РТ- 40) и замедляющего органа (например РВ-134), который нужен для обеспечения селективности защиты.

Селективность действия смежных МТЗ достигается путем согласования их срабатывания во времени по ступенчатому принципу. Величина ступени Δ t выбирается такой, чтобы при КЗ в точке К1 МТЗ II не успела сработать (см. рис. 1). Как правило у аналоговых защит Δ t = 0,5с, у цифровых защит Δt может достигать 0,1с.

Требования к МТЗ (к выбору тока с.з.):

1. МТЗ не должна срабатывать при прохождении максимального тока нагрузки.

2. МТЗ должна надёжно действовать на защищаемом участке и иметь К ч ≥ 1,5 т.е. тока двухфазного КЗ, произошедшего в конце основной зоны защиты в 1,5 и более раз;

3. МТЗ должна действовать и при КЗ на смежном (резервном) участке и иметь К_ч>1,2. , т.е. ток срабатывания защиты должен быть меньше тока двухфазного КЗ, произошедшего в конце основной зоны защиты в 1,2 раза;

4. Реле тока МТЗ должны вернуться в исходное положение от тока нагрузки линии после отключения КЗ на смежном участке, называемым внешним КЗ. (поэтому важно чтобы коэффициент возврата Кв был высокий, к.п. не ниже 0,8.

ТО (токовая отсечка)

ТО — разновидность МТЗ, обеспечивает быстрое отключение места КЗ. Отличается от МТЗ отсутствием органа замедления и способом выбора тока срабатывания защиты

В сетях с изолированной нейтралью применяется для защиты от межфазных КЗ ЛЭП, трансформаторов небольшой мощности (до 4000 кВА) и электродвигателей мощностью до 5000 кВт путем отключения без выдержки времени.

Т.к. ТО защищает только от межфазных КЗ, поэтому она применяется совместно с МТЗ, в этом случае такая защита носит название двухступенчатой токовой защиты (МТЗ).

ЭлектрО — Токовые защиты

ТОКОВЫЕ ЗАЩИТЫ

Для
защиты от междуфазных коротких замыканий широко применяют максимальные токовые
защиты и токовые отсечки. Их используют также для защиты от однофазных
замыканий на землю.

Максимальной токовой
называют защиту, действующую в случаях, когда ток в защищаемой цепи
превышает значение, равное максимальному рабочему току этой цепи. Эта защита
является наиболее надежной, дешевой и простой по выполнению. Ее применяют для
защиты кабельных и воздушных линий при одностороннем их питании, генераторов,
трансформаторов, вы­соковольтных электродвигателей.

Максимальная
токовая защита относится к защитам с вы­держкой времени. Ее обычно выполняют с
помощью электромаг­нитных реле максимального тока и реле времени.

На
рис. 1 показана принципиальная однолинейная схема максимальной защиты, выполненной
с помощью электромагнитного реле максимального тока РТ 1 и реле времени РВ 2. В
нормальном режиме работы защищаемого звена контакты реле 1 и 2 разомкнуты. При увеличении
тока в обмотке ре­ле 1 до определенного значения I_с.з
(ток срабатывания защиты), оно срабатывает и
замыкает своими контактами цепь об­мотки реле времени, которое приходит в
действие и через за­данную выдержку времени за­мыкает контактами цепь от­ключающей
катушки 4 привода выключателя; выключатель отключается. В схеме
предусмотрена оперативная цепь постоянного тока, заблокированная через
блок-контакт 5 привода выключателя В.
При отсутствии блок-контактов контакты реле 2 при размыкании
отключили бы ток в отключающей катушке привода, вследствие чего они могли бы
быть повреждены (из-за недостаточной мощности на размыкание).

Рис. 1. Принципиальная однолинейная схема (а) и характеристика (б) максимальной токовой защиты с
независимой выдержкой времени.

Время
действия защиты t_з,
зависит от времени срабатывания реле 2 и не зависит от силы тока
короткого замыкания в обмотке токового реле 1, поэтому такую защиту называют защитой с не­зависимой
выдержкой времени.

Указательное
реле РУ 3 является вспомогательным и служит для сигнализации срабатывания
реле.

В
радиальных сетях с односторонним питанием максималь­ную токовую защиту включают
с питающей стороны каж­дой линии. При этом для обеспечения селективности
отключе­ния выдержку времени защиты подбирают по ступенчатому принципу,
согласно которому у каждой последующей защиты, считая по направлению к
источнику питания, выдержку времени принимают на ступень времени больше, чем у
предыдущей за­щиты.

Рассмотрим
пример защиты от однофазного короткого замы­кания на землю кабельных линий в
сети напряжением 6…10 кВ с заземленной нейтралью (рис. 2). Действие защиты
основано на том, что в нормальном режиме суммарный поток, создава­емый
трехфазной системой токов в жилах кабеля 1, равен нулю. При замыкании на землю одной из фаз кабеля 1 симметрия
токов нарушается и возникает магнитный поток в магнитопроводе 2, который наведет ЭДС в обмотке 3 трансформатора
тока Т3 и в цепи реле Т появится
ток. Реле срабатывает и дает сигнал о наличии повреждения в данной кабельной
линии.

Рис. 2. Защита от замыканий на землю в кабельных
сетях: а – установка трансформаторов
тока типа ТЗ; б – схема действия
защиты.

Токовая отсечка
 может быть выполнена быстродействующей
или с выдержкой времени. В отличие от максимальной токовой защиты отсечка (рис.
3) заранее ограничивается зоной дейст­вия. Это делается для соблюдения
селективности (избиратель­ности действия), которая обеспечивается путем выбора
тока сра­батывания отсечки, а не выдержки времени (при максимальной токовой
защите).

Рис. 3. Принципиальная схема сети (а) и характеристики (б), поясняющие принципы действия токовой
отсечки линии с односторонним питанием.

Известно,
что ток короткого замыкания в линии определяется значением сопротивления от
источника питания до места повреж­дения и уменьшается с удалением последнего (см.
рис. 3, б, кривая 1). Наименьший ток короткого замыкания
возникает при повреждении в конце линии (в точке К2),
а наибольший — в ее начале (в точке К3).
Токовое реле РТ отсечки отстраивают от тока короткого
замыкания I_К1
при повреждении в точке К1, расположенной в начале
линии Л2.
Ток короткого замыкания при повреждении в точке К1 численно
равен току короткого замыка­ния при повреждении в точке К2.
Для отстройки ток срабатыва­ния токовой отсечки I_с.отс
принимают больше I_К2 в
режиме наи­больших токов короткого замыкания, т. е.: I_с.отс
= К_н I_К2,
где К_н
– коэффициент   надежности,   принимаемый  
равным 1,2…1.5.

При
токе срабатывания I_с.отс
токовая отсечка (см. рис. 3, б) действует
только при коротком замыкании на участке Л1а линии и не действует при
коротком замыкании на участке Л1б линии Л1 а
также вне ее, т. е., например на сборных шинах Л2 или
на линии
Л2 (точка
K1)

Следовательно, токовая
отсечка защищает не всю, а только часть линии.

Для
защиты участка Л2
на линии со стороны питания устана­вливают дополнительную
защиту, в качестве которой может быть выбрана, например, максимальная токовая
защита с вы­держкой времени. Токовую отсечку выполняют по схеме мак­симальной
токовой защиты (см. рис. 3, а), но
быстродейст­вующую отсечку выполняют без реле времени.

19.Схемы токовых защит. Схема
токовой защиты с независимой выдержкой времени на постоянном оперативном токе.
Совмещенное исполнение. Разнесенное исполнение.

Схемы токовых защит

Выбор схемы определяется назначе­нием защиты и предъявляемыми к ней
требованиями. Измеритель­ная часть у всех ступеней одинакова, поэтому если
защита содер­жит несколько ступеней, то их измерительные органы соединяются
между собой последовательно. При наличии отдельного органа вы­держки времени
логическая часть второй ступени и логическая часть третьей ступени защиты тоже
одинаковы. В этом случае одна и та же схема защиты может быть использована как
для выполне­ния токовой отсечки с выдержкой времени, так и для выполнения
максимальной токовой защиты. Нет различия и между схемами максимальной токовой
защиты и токовой отсечки без выдержки времени, выполненных на основе вторичных
реле прямого действия типа РТВ и РТМ. В системах электроснабжения часто используют
комбинированное реле РТ-80 или аналогичные полупроводниковые реле. Они
позволяют выполнить токовую защиту двухступенчатой, содержащей первую и третью
ступени.

Для изображения схем РЗиА применяются 
структурные и принципиальные схемы.

Принципиальные схемы – это наиболее полные схемы, которые показывают
взаимосвязь и принцип работы всех элементов схемы.

Принципиальные схемы делают в двух видах:

1.     В совмещенном.

2.     В разнесенном. 

В совмещеннй схеме
контакты реле на схеме совмещены с катушками реле. По мере усложнения схем РЗ
совмещенные схемы усложняются и теряют наглядность.

Поэтому применяется разнесенный способ изображения схем.

При применении этого способа отдельно изображаю
измерительные цепи РЗ и цепи управления, цепи создания выдержки времени и
т. д.   

В структурных схемах устройства защиты и автоматики разби­ваются на
отдельные блоки. Их изображают в виде прямоуголь­ников. Схема не показывает
принцип работы отдельных элементов, а лишь структуру устройства и взаимосвязь
между отдельными частями.

Функциональные схемы являются развитием структурных схем. Они более
детализированы.  Показывают взаимосвязь и
работу отдельных частей устройства.

Для токовых защит используются следующие схемы соединения
трансформаторов тока:

1.    
Полной звезды.

2.    
Неполной звезды.

3.    
на разность токов двух фаз.

Выбор типа реле
и схемы их соединения определяется:

1.    
Назначением защиты.

2.    
Предъявляемыми к ней требованиями.

Схема токовой защиты с независимой выдержкой времени на постоянном
оперативном токе.

Принципиальная схема, выполненная в совмещенном исполнении.

Защита выполнена по схеме
неполной звезды. Два трансформатора то­ка ТА1 и ТА2 установлены в фазах А и С
за выключателем Q. Вторичные
обмотки трансформаторов должны быть заземлены. К ним подключаются обмотки реле
тока КА1, КА2 типа РТ-40. По их обмоткам протекает переменный ток, а в
логической цепи – постоянный., Выдержка времени создается реле времени КТ типа
ЭВ-134. В схему защиты включены промежуточное реле КL типа РП-23 и указательное реле КН типа
РУ-1. При КЗ срабатывают реле тока КА1,КА2 и своими контактами КА1, КА2  замы­кают цепь обмотки реле времени КТ. Реле
времени начинает работать и с заданной выдержкой реле замыкает контакт КТ.  Цепь обмотки промежуточного реле замыкается,
оно срабатывает и замыкает контакт КL. Подается импульс на указательное реле KH и привод выключателя. Выключатель отклю­чается.

При этом указательное реле КН
фиксирует действие защи­ты на отключение. Контакт промежуточного реле КL не рассчитан на отклю­чение
тока электромагнита отключения УАТ. Поэтому в его цепь последовательно с
контактом реле КL
включен вспомогательный контакт выключателя Q, который размыкает цепь УАТ при отключении выключателя.

Схему можно использовать для вы­полнения
максимальной токовой защиты и для выполнения токовой отсечки с выдержкой
времени.

Принципиальная схема в разнесенном исполнении.

Функциональная схема  защиты.

Выбор уставок токовой отсечки

МЕХАНОТРОНИКА:

ПРОБЛЕМА ДАЛЬНЕГО РЕЗЕРВИРОВАНИЯ В СЕТЯХ 0,4 кВ

Сергей Гондуров, генеральный конструктор
Михаил Пирогов, начальник отдела системотехники
Илья Иванов, ведущий инженер отдела системотехники
ООО «НТЦ «Механотроника», г. Санкт-Петербург

Сети 0,4 кВ – важный узел в передаче электроэнергии от источника к потребителю. От его надежности напрямую зависит работа всех промышленных и сельскохозяйственных предприятий, электростанций и подстанций. Еще недавно проблема дальнего резервирования (ДР) сетей 0,4 кВ не имела качественного решения.

Осуществить резервирование в сети 0,4 кВ теми же методами, что и в высоковольтной сети не удавалось из-за существенного снижения тока короткого замыкания (КЗ) по мере удаления точки КЗ от источников питания.

Появление микропроцессорных устройств релейной защиты позволило решить проблему ДР в сетях 0,4 кВ благодаря реализации алгоритма, в основе которого лежит принципиально новая идея, ранее не существовавшая в мировой практике.

ТРАДИЦИОННАЯ МЕТОДИКА ВЫБОРА УСТАВОК

Рассмотрим проблему ДР на примере выбора уставок срабатывания защиты вводного выключателя подстанции 10/0,4 кВ мощностью 1000 кВА (рис. 1). Отметим, что в данном случае нагрузка Н1, Н2, Н3 не содержит в своем составе электродвигатели.

Рис. 1. Схема электроустановки

Уставки срабатывания защит выбираются в соответствии с рекомендациями [1].

Выбор уставок автоматического выключателя QF2 защиты электродвигателя

Токовая отсечка. Токовую отсечку выключателя отстраивают от пускового тока электродвигателя по выражению:

где K н – коэффициент надежности отстройки отсечки от пускового тока электродвигателя, принимается равным 1,5;
1,05 – коэффициент, учитывающий, что в нормальном режиме напряжение может быть на 5% выше U ном электродвигателя.

Уставка срабатывания токовой отсечки составляет I с.о. ≥ 3528 А. Выдержка времени срабатывания минимальна и составляет 0,1 с.

Защита от перегрузки. Ток срабатывания защиты от перегрузки определяется из условия возврата защиты после окончания пуска или самозапуска электродвигателя по выражению:

где K н – коэффициент надежности, учитывающий запас по току, неточности настройки и разброс срабатывания защиты;
K в – коэффициент возврата защиты;
I ном – номинальный ток электродвигателя.

Для автоматических выключателей серии ВА с полупроводниковым расцепителем БПР: K в = 0,97÷0,98, K н =1,19÷1,32. По выражению (2) I с.п. = 1,25 · I ном = 400 А.

Время срабатывания защиты от перегрузки принимается из условия несрабатывания защиты при пуске или самозапуске электродвигателя и определяется по выражению:

где t с.п. – время срабатывания защиты при токе, равном пусковому;
t пуск – длительность пуска электродвигателя.

Время срабатывания защиты от перегрузки t с.п. = 4,5 с.

Выбор уставок срабатывания защит автоматических выключателей QF4, QF5

Токовая отсечка. Ввиду отсутствия на данном присоединении двигательной нагрузки, уставка срабатывания отсечки определяется по следующему выражению:

где K н – коэффициент надежности, для автоматических выключателей серии ВА составляет 1,5;
I раб.макс – максимальный рабочий ток присоединения, равный в данном случае I ном .

По выражению (4) находим I с.о. = 1,5 · I раб.макс =108 А.

Согласование с отсечками выключателей отходящих линий не производим ввиду их отсутствия.
Уставка времени срабатывания токовой отсечки выбирается минимальная – 0,1 с.

Защита от перегрузки. На данных присоединениях защита от перегрузки не используется, в связи с этим установлены автоматические выключатели, имеющие только электромагнитные расцепители.

Выбор уставок срабатывания защит автоматического выключателя QF3

Токовая отсечка. Определяется по двум условиям, из которых принимается наибольшее значение.
1-е условие: несрабатывание при максимальном рабочем токе. Определяется по выражению (4) и составляет:

2-е условие: согласование с отсечками выключателей отходящих линий. Определяется по выражению:

где K н.с. – коэффициент надежности согласования, равный 1,4;
I с.о.л. – наибольший из токов срабатывания отсечек выключателей отходящих линий, составляющий 108 А.

По выражению (5) I с.о. = 151 А.
Таким образом, наибольшее значение I с.о. =216 А.
Выдержка времени срабатывания отсечки определяется по выражению:

где t с.о.л. – выдержка времени срабатывания отсечки выключателя отходящей линии;
Δt – ступень селективности, равная 0,15 с.
Уставка выдержки времени срабатывания токовой отсечки t с.о. = 0,25 с.

Защита от перегрузки. На данном присоединении защита от перегрузки не используется.

Выбор уставок срабатывания защит автоматического выключателя QF1

Токовая отсечка. Выбор уставки срабатывания отсечки вводного автоматического выключателя определяется при полной нагрузке секции и электродвигателя с наибольшим пусковым током:

где K н – коэффициент надежности, равный 1,5;
– сумма максимальных рабочих токов электроприемников, кроме двигателя с наибольшим пусковым током;
I пуск. макс – наибольший пусковой ток.

По выражению (7) ток срабатывания отсечки вводного выключателя составляет I с.о. = 4356 А.
Согласование с отсечками выключателей отходящих линий определяется по выражению (5) и составляет I с.о. = 4939 А.
Из полученных значений выбираем максимальное I с.о. = = 4939 А.
Выдержка времени срабатывания отсечки определяется по выражению (6) и составляет t с.о. = 0,4 с.

Защита от перегрузки. Уставка защиты от перегрузки рассчитывается так же, как и для электродвигателя (2), однако вместо I ном используется максимальный рабочий ток, который с учетом допустимой перегрузки трансформатора 1,2 составляет I раб.макс = 1,2 · I н.т. = 1734 А.
По выражению (2) уставка срабатывания защиты от перегрузки I с.п. = 1,25 · I раб.макс =2167,5 А.
Время срабатывания защиты в 2 раза больше длительности пуска электродвигателей и составляет t с.п. = 2 · t пуск = 6 с.

Анализ выбранных уставок

Рассчитав токи КЗ [2], представим их в виде графика (рис. 2), где кривая указывает значение тока дугового двухфазного КЗ на кабельной линии ВВГ 3×70 + 1×35 по мере удаления от шин подстанции. Значения I с.о. и I с.п соответствуют значениям уставок срабатывания защит вводного выключателя QF1. На графике видно, что токовая отсечка вводного выключателя QF1, начиная с 84 м, не выполняет резервирование защит отходящего выключателя QF3. Защита от перегрузки также не удовлетворяет выбору проводников по условиям нагрева при КЗ [4] и нарушает требования п.1.4.16 ПУЭ [3]. Это означает, что при возникновении КЗ вне зоны резервирования защиты вводного выключателя QF1 и при отказе отходящего выключателя QF3 произойдет термическое повреждение кабеля по всей его длине, а в наихудшем случае – пожар в кабельных каналах.

Рис. 2. Токи КЗ на кабельной линии ВВГ 3×70 + 1×35 по мере удаления от шин подстанции

Пример расчета дан для простой схемы, в которой преобладает нагрузка с малой кратностью пускового тока. В более сложных случаях (наличие групп электродвигателей средней и большой мощности) уставки вводного выключателя увеличатся и, как следствие, зона ДР резко сократится (до 60–70 м).

Существующие автоматические выключатели различных производителей не способны решить эту проблему, так как принцип действия их защит одинаков: сравнение действующего значения тока с уставкой, которая должна быть отстроена от токов пуска и самозапуска. Основная причина появления зон, в которых защита вводного выключателя не способна резервировать отходящие выключатели, – резкое, в отличие от сетей среднего и высокого напряжения, снижение токов КЗ по мере удаления от источника питания, а также большие пусковые токи электродвигателей.

Защита ДР должна быть построена с учетом этих явлений и выполняться на принципах, точно определяющих факт возникновения КЗ, а не факт превышения током КЗ уставки. Благодаря появлению блоков цифровой релейной защиты это стало осуществимо.

АЛГОРИТМ ДАЛЬНЕГО РЕЗЕРВИРОВАНИЯ

Впервые алгоритм ДР отказов защит выключателей был реализован А. В. Беляевым и М. А. Эдлиным в блоках БМРЗ-0,4 в 2000 г.

Многолетний опыт эксплуатации показал, что ДР в БМРЗ-0,4 надежно срабатывает при всех видах КЗ, достоверно определяет и не срабатывает при пусках или самозапусках электродвигателей, а также при повреждениях в высоковольтной сети. Алгоритм ДР основан на анализе переходного процесса, возникающего при КЗ, пусках или самозапусках электродвигателей. В основу алгоритма заложен анализ активного тока при возникновении КЗ в кабельных линиях и реактивного в случае пуска или самозапуска электродвигателей.

Особенность алгоритма ДР – анализ не абсолютных величин токов, а их производных, что существенно увеличивает зоны резервирования, ограниченные минимальным диапазоном измерения цифрового устройства, и позволяет с высокой точностью определить границу зоны ДР вне зависимости от нормируемых погрешностей измерений. Принцип функционирования данного алгоритма требует детального рассмотрения в отдельной статье.

Сегодня БМРЗ-0,4 – это единственное в мире устройство, которое проверено эксплуатацией и натурными испытаниями с реальными КЗ, выполняющее ДР отказов защит выключателей 0,4 кВ. Блоки БМРЗ-0,4 широко применяются на объектах нефтегазовой промышленности и в процессе эксплуатации зарекомендовали себя как надежное и качественное комплексное решение по защите и автоматике подстанции.

ВЫВОДЫ

В каждом проектном или эксплуатационном случае требуется проверка зон ДР для предотвращения пожаров в кабельных каналах. Проверку необходимо проводить для всех схем с кабельными линиями длиной более 60 метров.
Существующие модели автоматических выключателей не могут обеспечить ДР по принципу действия защиты.
Многолетний опыт эксплуатации доказал, что блоки БМРЗ-0,4 позволяют решить актуальную проблему ДР благодаря применению принципиально нового алгоритма.

ЛИТЕРАТУРА

1. Беляев А. В. Выбор аппаратуры, защит и кабелей в сетях 0,4 кВ. СПб.: ПЭИПК, 2008.
2. ГОСТ 28249-93. Короткие замыкания в электроустановках. Методы расчета в электроустановках переменного тока напряжением до 1 кВ. Минск, 1994.
3. Правила устройства электроустановок. 6-е изд., перераб. и доп.
4. О проверке кабелей на невозгорание при воздействии тока короткого замыкания: Циркуляр № Ц-02-98(Э). М., 1998.

Часто задаваемые вопросы о молекулярной замене

Как мне узнать, решил ли Phaser мою структуру?

Ответ на этот вопрос
подробно в разделе «Решил ли Phaser?» в основном руководстве Phaser, но его можно резюмировать следующим образом: окончательный
Z-оценка функции перевода (TFZ) должна быть выше 8, а логарифм правдоподобия
усиление (LLG) должно быть положительным и максимально высоким. Конечно, как и с
фазы эксперимента, возможность автосоздания большей части модели — единственный лучший критерий правильности
решение; в качестве альтернативы, выполнение одного раунда уточнения должно привести к R-free ниже 0.50.
Обратите внимание, что если после уточнения R-free выше 0,5, это часто указывает на
указывает на то, что решение действительно неверно — особенно в сочетании
с нестандартными значениями TFZ и / или LLG. Просто потому, что Phaser находит решение,
не означает, что он правильно решил структуру!

Почему Phaser не сообщает R-фактор?

R-фактор намного меньше
чувствительны, чем оценки TFZ и LLG, особенно при поиске
удаленные гомологи или небольшая часть общей рассеивающей массы.Phaser
записывает R-факторы для шага уточнения твердого тела в направлении
конец прогона, который можно найти в файле журнала. Однако если эти
значения относительно низкие (<40%), они не являются надежными индикаторами качество решения, поэтому в отчете представлены только Z-баллы и LLG.
графический интерфейс.

Что делать, если я не найду подходящего решения?

Это также подробно описано
в основном руководстве Phaser, в разделе «Что
делать в сложных случаях ».

Какое разрешение следует использовать?

Короче говоря, в большинстве случаев вы должны позволить Phaser выбирать пороги разрешения.Phaser использует предполагаемую точность модели (выраженную непосредственно как RMSD или
косвенно как идентичность последовательности), размер модели и оба
разрешение и количество дифракционных наблюдений для определения сигнала, который
будут получены для каждой модели в зависимости от разрешения. Это используется как
чтобы определить порог разрешения, которого должно хватить для успешного MR
поиск и оптимальный порядок поиска моделей. Эффекты навалом
растворитель при низком разрешении учитывается внутренне, поэтому вам не нужно
также можно указать отсечку с низким разрешением.

Следует ли использовать выходной файл MTZ от Phaser для уточнения?

Нет, для уточнения всегда лучше использовать исходный файл данных. МТЗ
файл из Phaser содержит коэффициенты карты, но в большинстве случаев вы найдете
что лучшие карты можно получить, немедленно запустив раунд доработки
или автоматизированная перестройка.

Как связаны содержимое ASU и поисковые ансамбли?

Технически они не связаны. Ансамбли используются в собственно MR.
поиск; содержимое ASU только сообщает Phaser, чего ожидать от общего
рассеивающая масса асимметричного блока (важный фактор в максимальном
оценка вероятности).Хотя вы можете указать только одну последовательность для каждого компонента,
вместо этого вы можете указать молекулярную массу для набора цепей. Ты можешь
также разбить модель на более мелкие ансамбли (например, разные домены)
сохраняя содержимое ASU одинаковым, или используйте модель поиска с несколькими цепочками, пока
указание файла последовательности для каждой цепочки.

Как заставить Phaser работать быстрее?

Phaser находится в постоянном развитии, при этом большое внимание уделяется
скорость, так что все, что мы могли бы здесь посоветовать, вероятно, уже делается
автоматически! Поскольку Phaser теперь автоматически выбирает самое низкое разрешение
ожидается, что даст четкое решение, изменение пределов разрешения не
рекомендуется и может даже увеличить время работы. Хорошая идея — создать
Phaser запускает поиск всех копий всех компонентов за одно задание, потому что это позволяет
Phaser для выбора оптимального порядка поиска и объединения решений для
несколько копий найдено за один поиск.

Может ли ФЕНИКС делать MRSAD?

Да, PHENIX может запускать MRSAD (молекулярное замещение в сочетании с фазами SAD) с помощью
использование информации о молекулярном замещении в процессе определения
аномальная субструктура рассеивателя. Однако для этого требуются отдельные шаги
выполнение MR и поиск подструктуры.Есть два простых способа
сделай это; оба описаны в документации AutoSol.

Я использую димер в качестве модели поиска. Почему я получаю предупреждение, что
элементарная ячейка переполнена?

Помните, что содержимое асимметричного блока определяется независимо
модели. Если вы предоставили одну последовательность для определения
Содержимое ASU, убедитесь, что вы указали, что содержимое
ассиметричного агрегата включают в себя два экземпляра.

Я хочу создать ансамбль моделей.Должен ли я сначала запустить Sculptor, а затем
Ансамблер или наоборот?

К сожалению, ни то, ни другое не является оптимальным. Когда Sculptor запускается первым, он удаляет
остатки от модели, и это может повлиять на способность Ensembler выполнять
оптимальная суперпозиция. Если используется сопоставление по умолчанию SSM , фрагментация
элементов вторичной структуры (заметных, когда модели расположены далеко) может привести
при неправильном сопоставлении, хотя это бывает редко. Когда Ensembler запускается первым, и
обрезка включена, результирующая трасса основной цепи может содержать много коротких
фрагменты, которые Скульптор выбросит, так как они не могут быть надежно
сопоставлены с последовательностью выравнивания и полнотой полученной модели
далее уменьшается.Лучшим компромиссом, вероятно, будет сначала запустить Sculptor, поэтому
что выравнивание последовательности с цепью может быть выполнено оптимальным образом. В общем
случаев, это не сильно ухудшает суперпозицию, так как
много сайтов для использования. В случае сбоя выравнивания SSM , другие алгоритмы сопоставления
(например, порядковые номера остатков).

Что мне следует запустить после того, как Phaser найдет хорошее решение?

Обычно мы рекомендуем один (или оба) из этих двух вариантов (и см. Следующий
вопрос для совета по более сложным случаям):

• Если модель поиска — это тот же белок (или достаточно близкий), а не
  ожидаются большие конформационные изменения, запустите phenix.уточнить, используя
  стратегия по умолчанию
  не менее 8-10 макроциклов, но с соответствующими настройками параметров
  разрешение данных: например, добавление ограничений NCS на низком уровне
  разрешение, если присутствуют несколько копий цепи, или добавление растворителя
  обновить в разрешении от среднего до высокого.
• Запустить AutoBuild; если в модели поиска используется существенно другой белок,
  выключите режим «перестройка на месте», чтобы построить совершенно новую модель.

Я запустил Phaser, он нашел решение, затем я запустил феникс.уточнить, а R-свободный
застревает выше 0,4 (но ниже 0,5). Как я могу это исправить?

Это открытый вопрос, имеющий множество объяснений и
возможные решения. Обычно мы рекомендуем стандартную серию проверок:

• Запустите Xtriage и проверьте свои данные на наличие
  патологии, которые могут затруднить уточнение (например, двойникование, неполное
  data, или трансляционный NCS).
• Очень важно, чтобы поисковая модель уже соответствовала последовательности
  целевой белок.Если вы запустите Phaser с гомологичной структурой на входе, вы
  сначала следует запустить Sculptor, чтобы при необходимости отредактировать поисковую модель. (Это не
  то же, что и моделирование гомологии — оно просто удаляет несоответствующие атомы,
  переименовывает и перенумеровывает остатки и корректирует B-факторы.) Уточнение не будет
  устраните остаточные проблемы, пропустив этот шаг.
• Проверьте, действительно ли решение MR является полным — это означает, что у вас есть
  размещено достаточно копий модели поиска, и эта модель поиска уже
  покрывает большую часть или всю цель. Разрывы в кристаллической упаковке или необычно большие
  капли разной плотности могут указывать на отсутствие рассеивателей. На низком
  разрешение разница плотности будет слабее, но вы все равно можете проверить
  решетка. Если вам не хватает важных частей модели, это будет
  ограничьте, насколько низкими могут быть R-факторы.
• Убедитесь, что вы выполняете достаточно циклов доработки. Иногда это будет
  требуется много времени, чтобы сойтись; по умолчанию три цикла — это минимум
  рекомендуется.

Если и то, и другое указывает на то, что модель и данные достаточно разумны, это
вероятно, что есть различия / ошибки модели, которые выходят за рамки
сходимость уточнения.К счастью, это обычно легко узнать в
карты разницы даже при низком разрешении; например, представитель
тестовый пример при 4,0 Å (описан в DiMaio et al. 2013):

Здесь очень хорошо видно, что модель просто не соответствует требованиям (хотя
большая часть белка, в основном за пределами поля зрения, более или менее
правильный). В этом случае вы можете попробовать несколько инструментов, многие из которых
были специально разработаны для решения этого класса проблем:

• Если у вас есть данные с разрешением от среднего до высокого (не менее 3.0Å) можно попробовать
  построение совершенно новой модели в AutoBuild. Это медленнее, чем уточнение, но
  имеет очень широкий радиус схождения.
• Может оказаться полезной процедура преобразования модели; это доступно как
  вариант AutoBuild и отдельная программа.
• Гибридное усовершенствование Rosetta-Phenix
  также был разработан для подобных случаев.

Усовершенствование

• DEN также было разработано для
  со структурами, которые нуждаются в более агрессивном улучшении и доказали свою полезность
  во многих подобных случаях.
• В крайнем случае можно попробовать MR-Rosetta;
  это способно улучшить очень плохих решений MR, но значительно
  вычислительно дороже, чем другие методы.
• Иногда достаточно добавить имитацию отжига в phenix. refine
  (хотя для примера, изображенного выше, этого не было).

Дополнительно, если для использования доступны несколько структур одного и того же белка
в качестве поисковых моделей мы рекомендуем проверить, не подходит ли какой-либо из них ближе к
цель, чем текущая модель поиска.

Мне действительно нужно включать несколько моделей в мои ансамбли?

Нет, мы используем термин «ансамбль» в этом контексте для обозначения любой модели поиска; во многих
случаях для решения структуры достаточно одной модели (и они могут
работать будет намного проще).

В чем разница между «высоким разрешением» и «высоким разрешением для
доработка »?

Последний применяется при «доработке и фазировании»
только шаг; для поиска вращения и перевода первым параметром является
использовал.

Как искать несколько уникальных ансамблей?

Вкладка «Процедура поиска» позволяет настроить эту процедуру. Искать
несколько независимых ансамблей, представляющих разные сущности в
сложный («a AND b AND c»), нажмите кнопку «Добавить поиск»
под вкладкой, и для каждого поиска отметьте ансамбль (ы), который
используется на этом этапе. Поиск будет выполняться в порядке их появления.
в графическом интерфейсе. Обратите внимание, что это , а не , как проверка нескольких
ансамбли для одного поиска, как описано в следующем вопросе.

Как мне сказать Phaser выбрать лучшее решение среди нескольких похожих
ансамбли?

Попробовать несколько альтернативных ансамблей (соответствующих одной и той же
сущность в кристалле) сразу («a OR b OR c»), проверьте
поле рядом с каждым ансамблем, который Phaser должен попробовать для одного поиска; Только
один из них будет фактически помещен в выходную модель.
(Вы, конечно, можете указать любую комбинацию поисков и ансамблей,
например, «(a OR b) AND c», это будет два отдельных поиска
инструкции.)

Я хочу запустить новый поиск в Phaser, начиная с результатов
Предыдущая работа. Как это указать?

Если предыдущее задание выполнялось в
графический интерфейс Phenix, вы можете выбрать его из раскрывающегося меню с надписью «Использовать
частичное решение из предыдущего задания »на вкладке« Вводные и общие параметры ».
Это автоматически загрузит решение. Обратите внимание, что в отличие от CCP4i
интерфейс, Phaser-MR в Phenix не использует файлы .sol, поскольку
информация передается внутри.Затем вам следует загрузить новые ансамбли.
искать; ансамбли, которые использовались в предыдущем прогоне, не нуждаются в
быть повторно загруженным, если вы не хотите найти больше копий. Если у вас уже есть
правильно предоставил полную информацию о содержимом ASU, это будет
не нужно менять.

Как запустить новый поиск, начиная с существующей модели в правильном
ориентация и перевод?

Это может применяться, если у вас есть усовершенствованная модель или решение от другого производителя.
программа.В этом случае вы должны добавить модель как ансамбль и проверить
коробка «Ансамбль — это фиксированное частичное решение». Это проинструктирует Phaser принять
входные координаты без изменений и перейти к следующему ансамблю, чтобы
ищи. Вам не нужно указывать отдельный поиск для этого ансамбля, так как
он будет включен автоматически.

Как указать программе использовать локальное зеркало PDB вместо выборки
записи удаленно?

См. Общий список часто задаваемых вопросов.

Почему mr_rosetta бомбит и говорит «ошибка при загрузке разделяемых библиотек:
libdevel.so: невозможно открыть файл общих объектов: нет такого файла или каталога »?

Это может означать, что где-то ваша система определяет разделяемые библиотеки.
что нужно Розетте, и это для места, которое не там, где Розетта
ожидает, что они будут. Вы можете попробовать игнорировать предыдущие определения
так:

Если вы используете оболочки bash или sh:

экспорт PHENIX_TRUST_OTHER_ENV = 1
 

или csh (C-shell):

setenv PHENIX_TRUST_OTHER_ENV 1
 

в скрипте, в котором вы запускаете mr_rosetta, или перед тем, как запустить его из команды
линия.

Почему mr_rosetta или mr_model_preparation bomb и говорит
«RuntimeError: не удается связаться со службой EBI DbFetch»?

Это может означать именно то, что написано … но также может означать
что вы находитесь за брандмауэром и вам нужен прокси-сервер
пройти. Вы можете использовать следующие
команда для указания прокси-сервера (заменив его на ВАШ прокси-сервер).

Если вы используете оболочки bash или sh:

экспорт HTTP_PROXY = proxyout.mydomain.edu: 8080
 

или csh (C-shell):

setenv HTTP_PROXY прокси-сервер.mydomain.edu:8080
 

Проблемы при установке Rosetta? Вот несколько предложений:

• Загрузите rosetta_source и rosetta_database отдельно. Пакет
  не содержит всех файлов.

• Компиляция не выполняется на RHEL 6.1 (проблема gcc 4.5), но не работает на RHEL 5.5.

• Убедитесь, что среда настроена правильно: $ PHENIX_ROSETTA_PATH
  должен указывать на каталог установки Rosetta
  (где находятся rosetta_source и rosetta_database). (Обратите внимание на опечатку
  в документации с ROSETTTA вместо ROSETTA; исправлено сейчас.)

• все каталоги в установке Rosetta должны быть доступны для
  пользователей:

  найти $ PHENIX_ROSETTA_PATH -type d -exec chmod 755 '{}' \;
   

Как указать программе использовать локальное зеркало PDB вместо выборки
записи удаленно?

См. Общий список часто задаваемых вопросов.

• Улучшенное замещение молекул за счет оптимизации структуры белка на основе плотности и энергии. F. DiMaio, T.C. Тервиллигер, Р.Дж. Рид, А. Влодавер, Г. Обердорфер, У. Вагнер, Э. Валков, А. Алон, Д. Фасс, Х.Л. Аксельрод, Д. Дас, С. Воробьев, Х. Ивай, П.Р. Поккулури, Д. Бейкер. Природа 473 , 540-3 (2011).

• Улучшенное кристаллографическое уточнение низкого разрешения с помощью Phenix и Rosetta. F. DiMaio, N. Echols, J.J. Headd, T.C. Тервиллигер, П. Адамс и Д. Бейкер. Нат Методы 10 , 1102-4 (2013).

Часто задаваемые вопросы об экспериментальной фазе

Что делать, если autosol говорит «эта версия не кажется достаточно большой»?

Autosol пытается автоматически определить размер решения или решения,
но если ваши данные имеют очень высокое разрешение или очень большую элементарную ячейку, вы
можно получить сообщение:

************************************************* *
Извините, эта версия кажется недостаточно большой ...
(Текущее значение isizeit - 30)
К сожалению, ваш компьютер принимает только размер 30
с вашими текущими настройками.Вы можете попробовать уменьшить разрешение
Вы можете попробовать "coarse_grid", чтобы уменьшить объем памяти
Вы можете попробовать "unlimit" разрешить полное использование памяти
************************************************* *
 

Вы не можете избавиться от этой проблемы, указав разрешение с помощью
разрешение = 4.0, поскольку autosol / autobuild / ligandfit использует разрешение
отсечку вы указываете во всех расчетах, но данные с высоким разрешением все еще
унесены.

Самое простое решение этой проблемы — отредактировать файл данных, чтобы он
данные разрешения.Сделать это можно так:

phenix.reflection_file_converter huge.sca —sca = big.sca —resolution = 4.0

или в графическом интерфейсе используйте редактор файла отражения.

Второе решение — указать autosol на
игнорировать данные с высоким разрешением
явно с помощью одной из этих команд (в командной строке или в графическом интерфейсе):

resolve_command = "'разрешение 200 4.0'"
решить_command = "'разрешение 200 4.0'"
resolve_pattern_command = "'разрешение 200 4.0'"
 

Обратите внимание на два набора кавычек; оба необходимы для этого ввода командной строки.В графическом интерфейсе требуется всего один набор кавычек.
Эти команды применяются после всех других входных данных в resolve / resolve / resolve_pattern, и поэтому все данные за пределами этих ограничений будут проигнорированы.

Почему мне не разрешено использовать файл с FAVG SIGFAVG DANO SIGDANO в autosol или autobuild?

Группа колонн МТЗ FAVG SIGFAVG DANO SIGDANO — особенная,
обычно не следует использовать в Phenix. Причина в том, что Феникс хранит это
данные как F + SIGF + F- SIGF-, но в процессе преобразования между F + / F- и
FAVG / DANO, информация потеряна.Поэтому вы обычно должны предоставлять данные
файлы с F + SIGF + F- SIGF- (или интенсивности) или полностью объединенные данные (F, SIG)
к процедурам Phenix. В качестве особого случая, если у вас есть аномальные данные, сохраненные как
FAVG SIGFAVG DANO SIGDANO вы можете передать это в autosol, однако для этого потребуется
либо (1) вы предоставляете файл уточнения с F SIG, либо (2) ваш
файл данных имеет отдельную пару столбцов F SIG (кроме
Столбцы FAVG SIGFAVG, входящие в группу FAVG / DANO).

Как указать маску для изменения плотности в autosol / autobuild /?

В автосборке вы можете просто использовать команду:

mask_from_pdb = my_mask_file.PDB
rad_mask_from_pdb = 2
 

, где my_mask_file.pdb содержит атомы, обозначающие маскируемую область. Все
точки в rad_mask_from_pdb атома в my_mask_file. pdb будут
считается внутри маски.

Если вы хотите указать маску в autosol, добавьте эту команду:

resolve_command_list = "'модель ../../coords.pdb' 'use_model_mask'"
 

, где есть «и» кавычки, а coords.pdb — это модель для использования
маска. Обратите внимание на «../../», потому что coords.pdb находится в
ваш рабочий каталог, но при разрешении запускается каталог запуска
на 2 каталога ниже, поэтому относительно этого каталога ваш coords.pdb это
в «../../coords.pdb».

Вы узнаете, что он работает, если в вашем файле resolve_xx.log указано:

Использование маски модели, рассчитанной по координатам
 

Примечание: эту команду лучше всего использовать с ключевым словом
maps_only = True, потому что phenix.autobuild тоже
использует model = … так что итеративное построение модели может не работать
в данном случае совершенно правильно. Две части, которые могут не работать
правильно «build_outside_model» (который будет использовать вашу модель как
маска, а не текущая), и Assessment_model (который будет
оцените свою стартовую модель, а не текущую).

Что мне делать, если автоматическая сборка сообщает TRIED resolve_extra_huge … но не в порядке?

В большинстве случаев, когда вы получаете эту ошибку в phenix:

TRIED resolve_extra_huge ... но не в порядке
 

на самом деле означает, что на вашем компьютере недостаточно памяти для
запустить resolve_extra_huge «. Если это так, то вы своего рода
застрял, если у вас нет другого компьютера с еще большим объемом памяти + пространство подкачки,
или вы уменьшите разрешение входных данных (обратите внимание, что у вас
чтобы фактически снизить разрешение во входном файле, а не только
установите «разрешение =», потому что все данные сохраняются, но не используются, если вы
просто выставил разрешение).

Вы также можете попробовать ключевое слово:

resolve_command_list = "грубая_сетка" "
 

(примечание 2 набора цитат)

Иногда может появиться сообщение «Не в порядке», если ваша система и PHENIX не
сопоставление, так что решение или решение не могут выполняться вообще. Вы можете проверить это
набрав:

phenix.resolve
 

, и если он загружается (просто введите QUIT или END или Ctrl-C, чтобы завершить его), то он
запускается, а если этого не происходит, имеется системное несоответствие.

Как я могу указать autosol, какие столбцы использовать
из моего файла mtz?

В графическом интерфейсе это выполняется автоматически, и доступные столбцы будут
загружается в раскрывающиеся меню.В командной строке
autosol обычно пытается угадать соответствующие столбцы
данных из файла входных данных. Если есть несколько вариантов, то вы
может сказать autosol, какой из них использовать с
command_line ключевые слова label, peak.labels, infl.labels и т. д.
Например, если у вас есть два файла входных данных w1 и w2 для
2-волновой набор данных MAD, и вы хотите выбрать данные w1 (+) и w1 (-) из
первый файл и w2 (+) и w2 (-1) из второго,
вы можете использовать следующие ключевые слова (см. «Как узнать, что
я выбираю метки для моего файла данных, «чтобы знать, что поставить
в этих строках):

input_file_list = "w1. mtz w2.mtz "
group_labels_list = "'w1 (+) SIGw1 (+) w1 (-) SIGw1 (-)' 'w2 (+) SIGw2 (+) w2 (-) SIGw2 (-)'"
 

Обратите внимание, что все метки для одного набора аномальных данных из одного файла
сгруппированы в каждый набор цитат.

Вы можете сделать то же самое из файла параметров
указав что-то вроде:

wavelength {
  wavelength_name = пик
  data = w1.mtz
  метки = w1 (+) SIGw1 (+) w1 (-) SIGw1 (-)
}
wavelength {
  wavelength_name = infl
  data = w2.mtz
  метки = w2 (+) SIGw2 (+) w2 (-) SIGw2 (-)
}
 

Как мне узнать, какие ярлыки я выбрал для моего файла данных?

Вы можете узнать, какие ярлыки вы выбрали, выполнив команду:

феникс.autosol show_labels = w1.mtz
 

Это предоставит список ярлыков в w1.mtz и предложения по их
использовать в autosol / autobuild / ligandfit. Например ярлыки для w1.mtz дают:

Список всех наборов аномальных данных в w1.mtz
'w1 (+) SIGw1 (+) w1 (-) SIGw1 (-)'

Список всех наборов данных в w1. mtz
'w1 (+) SIGw1 (+) w1 (-) SIGw1 (-)'

Список всех отдельных ярлыков в w1.mtz
'w1 (+)'
'SIGw1 (+)'
'w1 (-)'
'SIGw1 (-)'

Предлагаемое использование:
метки = 'w1 (+) SIGw1 (+) w1 (-) SIGw1 (-)'
input_labels = 'w1 (+) SIGw1 (+) None None None None None None'
input_refinement_labels = 'w1 (+) SIGw1 (+) Нет'
input_map_labels = 'w1 (+) Нет Нет'
 

Почему я получаю сообщение «Ни одна из версий решения не сработала» в autosol?

Если вы получили это или подобное сообщение о решении, сначала взгляните на ПОСЛЕДНЕЕ.БРЕВНО
если он существует в вашем каталоге AutoSol_run_xx_ или AutoBuild_run_xx_. Конец
этого файла может подсказать вам, что было не так.

Следующее, что нужно попробовать — запустить одну из этих команд (просто kill
их с помощью Ctrl-C, если они запускаются):

phenix.solve
 

или:

phenix.resolve
 

Если эти нагрузки решают или разрешают, то они в основном работают, и проблема
вероятно, из-за размера вашего набора данных, проблемы с форматированием или чего-то подобного.

Если они не работают, значит проблема в настройке вашей системы.Если ты
используя redhat linux, попробуйте изменить параметр selinux на selinux = disabled
в вашем файле / etc / sysconfig / selinux.

Также возможно, что у вас нет
приложение csh установлено
в вашей системе. Если у вас Ubuntu linux, csh и tcsh не включены в
нормальная установка. Под Linux легко установить csh и tcsh
и это займет всего минуту. В Ubuntu или Debian вы можете сказать:

apt-get install tcsh
 

или в Fedora или CentOS и подобных дистрибутивах:

ням установить tcsh
 

, и это должно сработать.

Как я могу быстро проверить различия ISO и Ano в наборе данных MIR?

Можно сказать:

phenix.autosol native.data = native.sca производный.data = производный.sca
 

и подождите пару минут, пока он не масштабирует данные (как только он
говорит «RUNNING HYSS», вы уже достаточно далеко), а затем посмотрите:

AutoSol_run_1_ / TEMP0 / dataset_1_scale. log
 

, что скажет ближе к концу:

изоморфные различия производные 1 - нативные

Отличия по оболочке:

shell dmin nobs Fbar R scale SIGNAL NOISE S / N

1 5.600 1018 285,012 0,287 0,998 105,05 26,73 3,93
2 4.200 1386 324.927 0.216 1.000 84.78 26.76 3.17
3 3,920 542 330,807 0,214 1,002 85,00 28,36 3,00
4 3,710 523 286,487 0,237 1,002 81,31 27,29 2,98
5 3,500 662 282,383 0,235 1,001 75,58 37,12 2,04
6 3,360 518 255,782 0,241 1,003 72,69 27,18 2,67
7 3,220 630 237,778 0,253 1.000 68,87 29,94 2,30
8 3,080 727 208.271 0,255 1,000 61,39 29,19 2,10
9 2,940 897 190,044 0,254 0,999 42,78 42,99 1,00
10 2,800 1067 169,022 0,280 0,999 50,54 33,24 1,52

Итого: 7970 256,096 0,245 1,000 75,29 31,41 2,48
 

Здесь R — / (2 ),
шум <сигма>,
сигнал — sqrt (<(Fderiv-Fnative) ** 2> — ),
и S / N — отношение сигнала к шуму.

Я запустил autosol, чтобы получить частичную модель, которую теперь хочу доработать.Какие данные
файл, который я должен указать в качестве ввода: исходный файл . sca из HKL2000 или файл
General_best_refine_data.mtz из автосол?

Всегда используйте вывод файла MTZ с помощью autosol. Он содержит новый набор R-free
флаги, которые использовались для уточнения модели; начиная с .sca
файл приведет к созданию нового набора флагов, который смещает R-free.

Все, что вам нужно знать о MasTec (MTZ) Повышение рейтинга для покупки

Bloomberg

У Crypto Kid была квартира за 23 000 долларов в месяц.Затем пришли федералы

(Bloomberg) — Стефану Цину было всего 19, когда он утверждал, что владеет секретом криптовалютной торговли. Ободренный юношеской уверенностью Цинь, самопровозглашенный математический вундеркинд из Австралии, бросил учебу в колледже в 2016 году, чтобы основать хедж-фонд в Нью-Йорке, который он назвал Virgil Capital. Он рассказал потенциальным клиентам, что разработал алгоритм под названием Tenjin для мониторинга обменов криптовалютами по всему миру, чтобы отслеживать колебания цен. Спустя чуть больше года после его открытия он похвастался, что фонд вернул 500%, и это заявление вызвало у инвесторов поток новых денег. У него стало так много денег, что Цинь подписал договор аренды в сентябре 2019 года на квартиру за 23000 долларов в месяц в 50 West, 64-этажное роскошное здание кондоминиума в финансовом районе с панорамным видом на нижний Манхэттен, а также с бассейном и сауной. , паровая баня, джакузи и гольф-симулятор. На самом деле, по словам федеральной прокуратуры, операция была ложью, по сути, схемой Понци, которая украла около 90 миллионов долларов у более чем 100 инвесторов, чтобы помочь оплачивать роскошный образ жизни Цинь и личные вложения в такие высокие -рисковые ставки в качестве первоначального предложения монет.В какой-то момент, столкнувшись с потребностями клиентов в их деньгах, он по-разному винил в своих проблемах «плохое управление денежными потоками» и «ростовщиков в Китае». На прошлой неделе 24-летний Цинь, выражающий раскаяние, признал себя виновным в федеральном суде Манхэттена по одному пункту обвинения в мошенничестве с ценными бумагами. «Я знал, что то, что я делал, было неправильным и незаконным», — сказал он окружному судье США Валери Е. Капрони. которые могут приговорить его к более чем 15 годам лишения свободы. «Я глубоко сожалею о своих действиях и проведу остаток своей жизни, искупая то, что сделал.Я глубоко сожалею о вреде, который мое эгоистичное поведение причинило моим инвесторам, которые доверяли мне, моим сотрудникам и моей семье ». Активные инвесторы Этот случай перекликается с аналогичным мошенничеством с криптовалютой, таким как BitConnect, обещая людям двузначные и трехзначные доходы и обходится инвесторам в миллиарды. Подобные схемы Понци показывают, как инвесторы, стремящиеся заработать на горячем рынке, могут легко сбиться с пути, обещая большую прибыль. Канадская биржа QuadrigaCX рухнула в 2019 году в результате мошенничества, в результате чего 76000 инвесторов понесли убытки на сумму не менее 125 миллионов долларов.В то время как регуляторный надзор за криптовалютной индустрией ужесточается, в этом секторе много неопытных участников. Около 800 криптовалютных фондов по всему миру управляются людьми, не знакомыми с Уолл-стрит или финансами, включая некоторых студентов и недавних выпускников, которые открыли фонды несколько лет назад. Путь Цинь также начался в колледже. Он был математиком и планировал стать физиком, рассказал он сайту DigFin в профиле, опубликованном в декабре, всего за неделю до того, как к нему обратились регулирующие органы.Он описал себя на своей странице в LinkedIn как «квант с глубоким интересом и пониманием технологии блокчейн». В 2016 году он добился принятия в программу для высокопотенциальных предпринимателей в Университете Нового Южного Уэльса в Сиднее с предложением использовать технология блокчейн для ускорения валютных операций. Он также посещал Minerva Schools, в основном онлайн-колледж, расположенный в Сан-Франциско, с августа 2016 года по декабрь 2017 года, как подтвердила школа. Crypto Bug Он получил криптографическую ошибку после стажировки в китайской фирме, сказал он DigFin.Его задачей было построить платформу между двумя площадками, одна в Китае, а другая в США, чтобы позволить фирме проводить арбитражные операции с криптовалютами. Убежденный, что он столкнулся с бизнесом, Цинь переехал в Нью-Йорк, чтобы основать Virgil Capital. Он сказал инвесторам, что его стратегия будет заключаться в использовании тенденции криптовалют к торговле по разным ценам на разных биржах. Он будет «нейтральным по отношению к рынку», что означает, что средства фирмы не будут подвержены колебаниям цен. И в отличие от других хедж-фондов, как он сказал DigFin, Вирджил не будет взимать плату за управление, взимая плату только на основе результатов деятельности фирмы.«Мы никогда не пытаемся делать легкие деньги», — сказал Цинь. По его словам, Вирджил быстро начал, заявив о 500% прибыли в 2017 году, что привлекло больше инвесторов, желающих участвовать. Маркетинговая брошюра хвасталась ежемесячной доходностью 10%, или 2811% за трехлетний период, закончившийся в августе 2019 года, как показывают юридические документы. Его активы получили дополнительный импульс после того, как Wall Street Journal представил его в статье в феврале 2018 года, в которой он навыки арбитража криптовалюты. По словам прокуратуры, Вирджил «испытал значительный рост, поскольку в фонд стекались новые инвесторы». Недостающие активыПервые трещины появились летом прошлого года. Некоторые инвесторы «все больше и больше расстраиваются» из-за отсутствия активов и неполных переводов, заявила в заявлении суда бывший глава отдела по связям с инвесторами Мелисса Фокс Мерфи. (Она покинула фирму в декабре.) Жалобы росли: «Сейчас Середина декабря, и моего МИЛЛИОНА ДОЛЛАРОВ НЕ НУЖНО ВИДЕТЬ», — написал один инвестор, имя которого было скрыто в судебных документах. «Это позор, как вы, ребята, обращаетесь с одним из своих первых и крупнейших инвесторов.По словам прокуратуры, примерно в то же время девять инвесторов со средствами в размере 3,5 миллиона долларов потребовали выкупа у флагманского фонда Virgil Sigma Fund LP. Но денег на перевод не было. Цинь опустошил Sigma Fund его активы. Балансы фонда были сфабрикованы. Вместо того, чтобы торговать на 39 биржах по всему миру, как он утверждал, Цинь тратил деньги инвесторов на личные расходы и инвестировал в другие нераскрытые высокорисковые инвестиции, включая первичное размещение монет, заявили в прокуратуре. Поэтому Цинь попытался остановиться. Он убедил инвесторов вместо этого передать свои интересы в свой VQR Multistrategy Fund, еще один криптовалютный фонд, который он основал в феврале 2020 года, который использовал различные торговые стратегии — и все еще имел активы. «Зоан Шаркс». Он также пытался вывести 1,7 миллиона долларов из VQR. Fund, но это вызвало подозрения у главного трейдера Антонио Халлака. В телефонном разговоре, записанном Халлаком в декабре, Цинь сказал, что ему нужны деньги для выплаты «ростовщикам в Китае», у которых он взял взаймы, чтобы начать свой бизнес, согласно материалам судебного иска, поданному Комиссией по ценным бумагам и биржам.Он сказал, что ростовщики «могут сделать что угодно, чтобы взыскать долги», и что у него была «проблема с ликвидностью», которая помешала ему погасить их. «Честно говоря, у меня было такое плохое управление денежными потоками», — сказал Цинь Халлаку. . «У меня сейчас нет денег, чувак. Это так грустно ». Когда трейдер отказался от вывода средств, Цинь попытался взять бразды правления над счетами VQR. Но к настоящему времени в этом была задействована SEC. Он заставил биржи криптовалюты заблокировать оставшиеся активы VQR, а неделю спустя подал иск.Возвращение активов К концу Цинь истратил практически все деньги, которые были в Sigma Fund. Назначенный судом управляющий, который наблюдает за фондом, стремится вернуть активы для инвесторов, сказал Николас Бейс, представитель прокурора Манхэттена Одри Штраус. По его словам, активы фонда VQR на сумму около 24 миллионов долларов были заморожены и должны быть доступны для рассредоточения. «Стефан Хе Цинь вытащил почти все активы из своего криптовалютного фонда в размере 90 миллионов долларов, украв деньги инвесторов, потратив их на послабления и т. Д. спекулятивные личные вложения и ложь инвесторам о результатах деятельности фонда и о том, что он сделал с их деньгами », — говорится в заявлении Штрауса.В Южной Корее, когда он узнал о расследовании, Цинь согласился вылететь обратно в США, заявили в прокуратуре. Он сдался властям 4 февраля, признал себя виновным в тот же день перед Капрони и был освобожден под залог в размере 50 000 долларов до вынесения приговора, назначенного на 20 мая. В то время как максимальное наказание, предусмотренное законом, предусматривает 20 лет тюремного заключения в рамках заявления о признании вины. прокуратура согласилась, что он должен получить от 151 до 188 месяцев за решеткой в ​​соответствии с федеральными правилами вынесения приговоров и штрафом в размере до 350 000 долларов. Эта судьба далека от карьеры, которую его родители предполагали для него — физика, как он сказал DigFin. .«Они не были слишком счастливы, когда я сказал им, что ушел из университета, чтобы заняться криптовалютой. Кто знает, может, когда-нибудь я получу диплом. Но на самом деле я хочу торговать криптовалютой ». Дело США против Цинь, 21-cr-75, Окружной суд США, Южный округ Нью-Йорка (Манхэттен) (обновления с комментарием прокурора и заголовком к делу). Дополнительные статьи Посетите нас на bloomberg.com. Подпишитесь сейчас, чтобы оставаться в курсе самых надежных источников деловых новостей. © 2021 Bloomberg LP

Интерфейс CCP4: экспериментальный модуль фазирования

Интерфейс CCP4: экспериментальный модуль фазирования

Файлы решений (файлы HA)

наборов данных слияния —

канадских долларов

Масштабирование и анализ наборов данных —
SCALEIT и FHSCAL

Масштабирование и анализ наборов данных —
Макет окна задач

Подготовка данных для поиска HA — Revise, Ecalc, MTZ2various

ACORN — ab initio Фазирование

SHELX — Поиск тяжелых атомов

RANTAN — Прямые методы

Professs — NCS от HA

Oasis — фазировка SAD / SIR

Создать карту Паттерсона

без учета большой интенсивности
Отличия

Создать карту Паттерсона —
Макет окна задач

Поиск Паттерсона в реальном пространстве — RSPS

Выполнить MLPHARE

Сбор данных

Карты

Этот модуль содержит следующие задачи:

Объединить наборы данных (CAD)

Масштабирование и анализ наборов данных

Подготовка данных для поиска HA

ACORN — ab initio Фазирование

SHELX — Поиск тяжелых атомов

RANTAN — Прямые методы

Professs — NCS из HA

Oasis — фазировка SAD / SIR

Создать карту Паттерсона

Поиск Паттерсона в реальном пространстве

Запуск MLPHARE

Помощь специалистов доступна по телефону:

ScaleChoose — выбор
правильная программа масштабирования для ваших наборов данных

Макет каждого окна задач, i. е. количество имеющихся папок,
и будут ли эти папки открыты или закрыты по умолчанию, зависит от выбора
сделано в папке Protocol задачи (см.
Вступление). Несмотря на то что
определенные папки закрыты по умолчанию, есть определенные причины, по которым вам следует
или может захотеть посмотреть на них. Эти причины описаны в окне задач.
Макет разделов ниже.

Файлы решений

Файлы Heavy Atom (.ha)

Файлы тяжелого атома (HA) — это короткие файлы, в которых записываются предлагаемые
узлы тяжелых атомов в структуре.Они аналогичны
MR файлы
Модуль молекулярной замены. Формат файла аналогичен
в строку ввода ATOM для программы уточнения тяжелых атомов MLPHARE.
На каждый сайт атома приходится одна строка, и строка имеет свободный формат и начинается с
слово ATOM:

ATOM имя_ атома x y z занятость anomalous_occupancy BFAC B-фактор
 

Интерфейс MLPHARE может использовать файл HA в качестве входных данных, а файлы HA выводятся по:

Программа PEAKMAX

с использованием опции OUTPUT FRAC

задача RANTAN

файлы фактически созданы программой PEAKMAX
который ищет карты, созданные из выходных фаз RANTAN

задача ACORN

файлы фактически созданы программой PEAKMAX
который ищет карты, сгенерированные из выходных фаз ACORN

Создание задачи карты Паттерсона

, когда параметр PEAKSEARCH установлен на

Задача поиска Real Space Patterson (RSPS)

, когда включен параметр анализа сайта
использовал. Сценарий для задачи читает файл журнала программы RSPS и извлекает
информация о сайтах в файлы HA

Задача MLPHARE

после каждого выполнения уточнения текущие уточненные координаты
извлекается из файла журнала в файл высокой доступности

Файлы HA создаются с именем файла по умолчанию, которое
project_jobid_n.ha , где n = 1,2,3 …. Если вы выберете HA
файл из меню под кнопкой Просмотр файлов из задания, он будет
отображается в программе просмотра файлов HA, аналогичной программе просмотра файлов MR, и
который имеет несколько простых функций для редактирования файла.Выбор строки в
файл поместит символ # в начало строки, а эта строка
тогда будет игнорироваться при вводе в MLPHARE. Второй выбор удалит
# персонаж. В нижней части экрана есть кнопка «Изменить все».
программа просмотра, которая добавит или удалит # во всех строках ATOM. Там
также кнопка Edit Columns, которая предоставляет параметры для установки атома
имя, занятость, аномальная занятость и B-фактор для всех атомов в файле.

Объединить наборы данных —

канадских долларов

Эта задача взаимодействует с программой CAD, которая может использоваться для:

1. Удалить столбцы из файла МТЗ
2. Объединить данные из двух или более файлов MTZ
3. Сбросить диапазон разрешения в файле (ах) MTZ
4. Изменение порядка сортировки, пределов HKL или пространственной группы

Чтобы ввести несколько файлов MTZ, нажмите кнопку Добавить входной файл MTZ.По умолчанию все данные из входного файла MTZ помещаются в выходной файл, но вы можете
измените параметр ввода со «все столбцы» на «выбранные столбцы», а затем выберите
столбцы с помощью кнопки Добавить столбец. Если вы хотите, чтобы большинство
столбцы в файле, затем нажмите кнопку Список всех столбцов и затем удалите
столбцы, которые вам не нужны, используя опцию Удалить выбранный элемент под
Кнопка меню «Редактировать список». Затем вам нужно будет выбрать столбец, нажав на
одно из полей этого столбца с помощью правой кнопки мыши. Смотрите также
Расширение рамок и
Переключить фреймы.

CAD не может обрабатывать более 29 столбцов.

Не включать столбцы H, K и L. Они передаются
выводить автоматически и только программу расстраивать.

Два специальных типа данных используются для обозначения того, что
вы готовите данные для различных типов функций перевода. Их:

U

частичный FC

V

частичный PHIC

Должен быть только один PHICpart FCpart для каждого входного файла, и они должны быть последними элементами, указанными для
ЛАБИН.CAD генерирует эквивалентные отражения, используя только ВРАЩАЮЩУЮ часть примитива.
оператор симметрии (, то есть , если пространственная группа P212121, эти отражения анализируются как
хотя космическая группа была P222). Это разрешено в
TFFC и
ПОИСК программ.

CAD — Макет окна задач

Функции, на которые следует обратить внимание в задаче САПР:

Название папки	Важность	Комментарий
Папка с файлами	Добавить входной файл MTZ	Чтобы включить более одного файла MTZ
Определить выход MTZ	переопределить группу пробелов, размеры ячеек, порядок сортировки, пределы hkl и т. д.	также можно выполнить с помощью SFTOOLS

См. Документацию по программе:
CAD,
SFTOOLS

Масштабирование и анализ наборов данных — SCALEIT и FHSCAL

Для масштабирования производных до исходных наборов данных доступны две программы CCP4: SCALEIT
и FHSCAL. В учебнике по изоморфной замене I. Tickle описывается
сильные и слабые стороны этих программ.
Обратите внимание, что не существует единственного решения проблемы масштабирования двух разных наборов данных.Различные проблемы могут возникнуть из:

Масштабирование наборов данных с аномальной дисперсией

Задача «Масштабирование наборов данных» запустит SCALEIT для масштабирования всех DPHn.
(дисперсионная разница для n-й длины волны).

При необходимости будет выполнено перекрестное сравнение наборов аномальных данных — это
включает повторный запуск SCALEIT с вводом:

LABIN FP = FPHn SIGFP = SIGFPHn FPh2 = FPHm SIGFPh2 = SIGFPHm DPh2 = DPHm SIGDPh2 = SIGDPHm
 

для всех возможных попарных комбинаций длин волн n и m. На основе этих прогонов R-фактор перекрестного сравнения и нормальная вероятность для ацентрических
данные извлекаются.

Также необязательно выполнять анализ дисперсионных различий путем повторного запуска SCALEIT.
с вводом:

LABIN FP = FPH (+) n SIGFP = SIGFPH (+) n FPh2 = FPH (-) n SIGFPh2 = SIGFPH (-) n
 

Из этого анализа, нормальные вероятности для ацентрических и центрических данных и
Rfactor извлечены. Входной файл MTZ должен содержать FPH (+) n и
FPH (-) n. Если у вас нет данных в этой форме, вам следует запустить
программа mtzMADmod
который преобразует DPHn в соответствующий вид.Эта программа не имеет интерфейса. Лучшее решение — использовать последнюю версию
Программа TRUNCATE, которая сохраняет на выходе значения FPH (+) n и FPH (-) n.

Результаты обоих этих анализов сведены в таблицу в итоговом файле под названием
проект _ jobid _scaleit.summary.

Масштабирование наборов данных — макет окна задач

В папке Protocol задачи Scale Datasets вы можете выбрать:

1. только анализ — используйте SCALEIT без уточнения
2. уточнение шкалы с использованием SCALEIT — используйте уточнение SCALEIT
3. уточнение шкалы с использованием FHSCAL (метод Краута) — используйте уточнение FHSCAL
4. Уточнение шкалы FHSCAL и анализ SCALEIT — по сути, комбинация опций
   1 и 3
5. применить входные масштабные коэффициенты — использовать SCALEIT с внешними масштабными коэффициентами —
   обычно не используется

Функции, на которые следует обратить внимание в задаче масштабирования наборов данных:

Параметр протокола	Название папки	Важность	Комментарий
1	Анализ	Графики различий между наборами данных	Анализ с учетом разрешения всегда выполняется.
2	Параметры уточнения	Применить масштабирование Уилсона	Окончательное масштабирование Уилсона (влияет только на коэффициент масштабирования) после масштабирования методом наименьших квадратов (масштаб Температурные факторы и ). Смотрите также Уилсон.
3	Параметры масштабирования Fhscal		Выполните масштабирование по Крауту с помощью FHSCAL. В крайних случаях, а именно, если предел высокого разрешения собственного набора данных ниже, чем у (одного из) производные, некоторые отражения могут не выводиться.Смотрите также Оговорка в документации программы FHSCAL.
4	Анализ	Анализ результатов FHSCAL	SCALEIT ANALYZE выполняется после масштабирования с помощью FHSCAL (см. Варианты протокола 1 и 3).
5	Входные коэффициенты масштабирования		Применены внешние шкалы и проведен анализ. Никаких уточнений. Смотрите также ШКАЛА.

См. Документацию по программе:
СКАЛЕИТ,
FHSCAL.

Подготовка данных для поиска HA — Revise, Ecalc, MTZ2various

Эту задачу нужно запустить в следующих случаях:

В окне задачи Prepare Data for HA Search вам нужно только указать
тип ваших данных и программу фазирования, которую вы собираетесь запустить, и интерфейс сделает
необходимые преобразования описаны
ниже.

Данные

MAD масштабируются программой REVISE, чтобы дать оценку нормализованного аномального
величина рассеяния (заданная меткой столбца FM от RANTAN и ACORN, но иногда обозначаемая как FA в
литература). Входные данные могут быть в форме F (+) и F (-) для каждой длины волны или быть
аномальные различия Дано для каждой длины волны. Выходной FM можно использовать в аналогичных
мода на единственное аномальное различие (Дано) или изоморфное различие (Дисо). Теория
за этим описано в
ПРОСМОТРЕТЬ программную документацию.

Преобразование данных

Программы прямых методов, такие как SHELX, RANTAN и ACORN, обычно работают с данными в виде
нормализованные интенсивности, а не структурные факторы, которые обычно используются в
макромолекулярная кристаллография. Поэтому данные структурного фактора необходимо преобразовать в нормализованные
амплитуды структуры для использования в программах прямых методов. Программа SHELX имеет внутренний
для выполнения этого преобразования, но данные, предназначенные для RANTAN и ACORN, должны пройти через
Программа ECALC, которая вычисляет нормализованные амплитуды конструкции (обычно с учетом столбца
этикетка E).

RANTAN, ACORN и все другие программы CCP4 работают с экспериментальными данными в формате файлов MTZ, но
SHELX требует данных в формате ASCII, описанном в документации SHELX. В
Подготовка данных для поиска HA Задача будет использовать MTZ2VARIOUS для преобразования файла MTZ в SHELX
формат.

См. Документацию по программе:
ИСПРАВЛЯТЬ,
МТЗ2 РАЗЛИЧНЫЙ,
ECALC.

ACORN —

ab initio Фазирование при атомном разрешении

ACORN — это процедура ab initio для решения структуры белка, когда
доступны данные атомного разрешения.В случае конструкции, содержащей тяжелые
атомов, его процедуры можно использовать для
определение аномальных рассеивателей по аномальным данным, где
разрешение может составлять от 3 Å до 4 Å.

MAD данные для ACORN должны быть предварительно обработаны программой REVISE
(см. выше), который генерирует оценки
FM, который является нормированным фактором аномального рассеяния. Вход для REVISE
FP и FPH (+) n и FPH (-) n для набора данных n.
Эти данные должны были быть масштабированы программой SCALEIT. REVISE также необходимо знать
длина волны, f ‘ и f’ для каждой длины волны.

Желудь — макет окна задач

Особенности, на которые следует обратить внимание в Задаче Желудь:

См. Документацию по программе:
ЖЕЛУДЬ,
ЭКАЛК,
ИСПРАВЛЯТЬ,
SCALEIT.

SHELX — Поиск тяжелых атомов

Программу SHELX можно получить по адресу
ГЛАВНАЯ СТРАНИЦА ШЕЛКС.
Интерфейс CCP4i предназначен для SHELXS-97. Чтобы скрипты CCP4i могли найти программу SHELX,
полный путь к программе необходимо ввести в окне настройки интерфейса, которое
доступ к нему осуществляется с помощью кнопки в меню системного администрирования в правой части главного окна.

Дополнительную информацию о программе SHELX см.
ГЛАВНАЯ СТРАНИЦА ШЕЛКС.
Здесь есть ссылки на различные часто задаваемые вопросы:
В
Домашняя страница SHELX; Часто задаваемые вопросы (макромолекулы) и
Томас
Часто задаваемые вопросы Шнайдера.

RANTAN — Прямые методы

Программа RANTAN Direct Methods может применяться для решения данных MAD или изоморфных
данные замены. Интерфейс настроит ключевые входные параметры соответствующим образом для
тип данных.

Для изоморфных данных RANTAN оптимально работает с вводом в виде нормализованных
амплитуды, а не структурные факторы, поэтому интерфейс обычно запускает ECALC
программа для преобразования SF в нормированные амплитуды. Альтернативно интерфейс позволит
ввод либо предварительно рассчитанных нормированных амплитуд, либо нормированных амплитуд и начальных
фазы.

Данные

MAD для RANTAN будут предварительно обработаны программой REVISE (см. Выше), которая генерирует оценки
FM, который является нормированным коэффициентом аномального рассеяния. Вход для REVISE
FP и FPH (+) n и FPH (-) n для набора данных n.
Эти данные должны были быть масштабированы программой SCALEIT. REVISE также необходимо знать
длина волны, f ‘ и f’ для каждой длины волны.

См. Документацию по программе:
РАНТАН,
ЭКАЛК,
ИСПРАВЛЯТЬ,
SCALEIT.

Professs — NCS от HA

PROFESSS — это инструмент, помогающий идентифицировать атомы, связанные с NCS, из
список позиций тяжелых атомов.На данный момент ПРОФЕСС работает только с «традиционными»
PDB файлы. Файлы HA, созданные ACORN или RANTAN (например), не могут быть загружены
в PROFESSS — файл HA необходимо преобразовать через
Преобразование форматов координат
в модуле Coordinate Utilities.

Professs — чтение вывода

Программа сначала перечисляет треугольники атомов, которые она нашла, а затем
анализирует каждую пару треугольников как возможное совпадение NCS. Для каждого возможного оператора
дается список всех подходящих атомов.Для каждой пары атомов коэффициент петли равен
перечисленные. Если оператор NCS представляет собой N-кратное вращение, атом будет частью «цикла»
N атомов (если один не отсутствует). Это вместе с соответствующим 3-м полярным углом может
подтвердить наличие надлежащего оператора NCS.

Атомы описываются порядковым номером атома из входной PDB, а также 4
номера указаны в квадратных скобках. Первый из них — это номер
операторы кристаллографической симметрии, а остальные три являются элементарной ячейкой
переводы, применяемые после оператора симметрии.

Professs — остерегайтесь

При вычислении расстояния между парой атомов все эквиваленты симметрии
учитывается, но учитывается только повтор ячейки, дающий наименьшее расстояние. В очень
В некоторых случаях кристаллографической симметрии низкого порядка это может приводить к пропуску атомов.

Oasis — фазировка SAD / SIR

OASIS — это компьютерная программа для устранения фазовой неоднозначности при аномальной длине волны.
Данные о рассеянии или однократном изоморфном замещении (замещении) белка.Фазовая проблема
сводится к проблеме знаков, когда узлы аномального рассеивателя или замещающего тяжелого атома
расположены. OASIS применяет процедуру прямого метода для устранения внутренней неоднозначности фаз.
к данным OAS или SIR.

Создать карту Паттерсона

Задача создания карты Паттерсона выполняет следующие действия:

• Запустите SCALEIT, чтобы найти оптимальную отсечку для исключения дефектов
  с подозрительно большими отличиями
• Запустите FFT PATTERSON в режиме секционирования по умолчанию, чтобы получить первое направление
  участков карты
• Запустите MAPMASK для получения выходной карты обратной засечки, чтобы получить все необходимые секции Харкера.
• Запустите PEAKMAX для поиска пиков на картах и ​​запишите их в файл «Координаты пиков» и
  в файл HA (см. выше)
• Участок Харкера с НПО

По желанию:

• Пользователь может указать координаты точек, которые будут нанесены на карту Паттерсона
• Пользователь может указать координаты предполагаемых узлов тяжелого атома и ВЕКТОРЫ
  программа запускается для определения предсказанных векторов кросс-вектора, которые затем наносятся на
  карта Паттерсона

Исключая большую разницу в интенсивности

Ошибочно большие различия интенсивности могут непропорционально повлиять на карту Паттерсона
поскольку используемый параметр, интенсивность, является квадратом структурного фактора, и
квадрат большого числа — очень большое число.Эффект, замеченный в паттерсоне
карта хребтов.

Поэтому обычно рекомендуется исключить отражения с очень высокой
отличия: FPH-FP от разницы Паттерсона и
FPH + -FPH- от аномальной разницы Паттерсона. По умолчанию
Интерфейс запустит программу SCALEIT для анализа данных и использования значения
4.1 * RMS (FPH-FP), которая является разумной первой оценкой подходящего порога. Это может быть
стоит попробовать разные значения отсечки и посмотреть на полученную карту Паттерсона —
используемое значение может быть установлено в верхней части папки Exclude Reflections .Исключение «хороших» отражений ведет к ухудшению качества карты, поэтому не рекомендуется
переоценить значение отсечки. Для очень хороших данных, возможно, нет необходимости исключать какие-либо
данные. В файле журнала SCALEIT также есть таблица изоморфных и (при необходимости) аномальных
разности, которые показывают количество отражений с заданными разностями как функцию
оболочки разрешения.

Создать карту Паттерсона — макет окна задач

Функции, на которые следует обратить внимание в задаче «Создание карты Паттерсона»:

Опция протокола	Название папки	Важность	Комментарий
разница Паттерсон	Исключить отражения	Исключить отражения с ошибочно большой разницей (интенсивность) между F1 и F2 ( i. е. FPH и FP)	см. Исключение большой разницы в интенсивности
аномальная разница Паттерсон	Исключить отражения	Исключить отражения с ошибочно большой разницей (интенсивностью) между F1 и F2 (, т.е. FPH + и FPH-)	см. Исключение большой разницы в интенсивности

См. Документацию по программе:
СКАЛЕИТ,
БПФ,
МАПМАСКА,
ПИКМАКС,
НПО,
ВЕКТОРЫ,
HAVECS.

Поиск Паттерсона в реальном космосе — RSPS

RSPS — это программа поиска по сетке, которая предоставляет параметры поиска (для решения производных тяжелых атомов) в виде
а также интерактивные варианты для изучения потенциальных решений (как соответствие потенциальных сайтов
разница карта Паттерсона).Все варианты работают в реальном и векторном пространстве. Возможен поиск
для определения положения тяжелых атомов или, при определенных условиях, для определения положения
молекулы с внутренней (NCS) симметрией. Цель RSPS — не создание полного решения для
Паттерсон, разность тяжелых атомов, а скорее найти достаточно узлов, чтобы позволить начальным фазам быть
рассчитано для разностного анализа Фурье.

Поиск осуществляется путем присвоения пробных позиций на сетке, покрывающей асимметричную единицу
кристалл, а затем вычисление оценки для каждой пробной позиции на основе плотностей Паттерсона
в позициях, соответствующих предсказанным векторам для каждой позиции.Из симметрии
операторы (кристаллографические и / или некристаллографические) все уникальные преобразования, отображающие точку
в реальном (кристаллическом) пространстве до точки в векторном (Паттерсоновском) пространстве. Другими словами, эти
преобразования отображают точку в реальном пространстве на векторы Паттерсона, связанные с этой точкой.

Запуск MLPHARE

MLPHARE может использоваться для уточнения изоморфных или аномальных данных. Проверить
Поле «Использовать данные аномальной разницы» в верхней части интерфейса MLPHARE, если
подходящее.Первоначальный интерфейс по умолчанию обеспечивает только описание одной производной
или длина волны; нажмите кнопку «Добавить другую производную» под надписью «MTZ in»
раздел, чтобы освободить место для дополнительных данных.

Минимальный требуемый ввод — это некоторые начальные определения тяжелых атомов в
папка Describe Derivatives & Refinement . Для каждой производной
введите имя и имя файла HA
содержащие данные для этого
производная. В качестве альтернативы введите ясность атомов, изменив Использовать данные
параметр меню «из файла», чтобы использовать данные, «введенные ниже», а затем введите
Информация.Вырезать и
Инструмент вставки может оказаться полезным. Для аномальных данных вы будете
необходимо ввести один и тот же файл HA для каждой длины волны.

Можно редактировать файлы HA «в режиме онлайн», нажав кнопку «Просмотр» на файле.
линия выбора. Средство просмотра файлов HA имеет несколько простых инструментов редактирования, но более сложные изменения.
может потребоваться сделать в редакторе.

Выходной файл MTZ содержит столбцы PHIB_mlphare1 , FOM_mlphare1
и др. . Если вы используете этот файл в качестве входных данных для другого запуска MLPHARE,
установить новое уникальное расширение имени столбца. Измените параметр ‘Идентификатор выходной метки’
от млфар1 до млфар2 . Каждый запуск MLPHARE в
Интерфейс также выводит по одному файлу HA для каждой производной.
Эти файлы HA можно использовать в качестве входных данных для следующего запуска MLPHARE.

В документации SCALEIT указано: «MLPHARE имеет встроенную схему взвешивания, которая
означает, что включение менее надежных данных в поэтапное внедрение не причинит большого вреда. В конце концов
бедный hkl должен получить низкие FOM, и тогда DM может использовать несколько отражений с разумными
фазы, чтобы помочь в процедуре продления фазы.«

Программа MLPHARE
в документации есть несколько полезных советов, например, :
«NB: если заполняемость станет близкой к 0,0, возможно смещение координат.
быть бессмысленным «, и целый раздел
Примечания по использованию.

Предлагаемые входные числа для предполагаемого отсутствия закрытия:

• Документация программы не предлагает никаких вводных данных для самого первого запуска.
• Интерфейс имеет значение по умолчанию 0,0 для всех чисел, даже в самом
  первый забег.
• Некоторые люди «всегда» используют определенное число (10% F ?!) в самом первом
  запустить.

Сбор данных

MLPHARE — одна из систем сбора данных
программы. См. Сбор данных в CCP4i
о последствиях для интерфейса.

Карты

Интерфейс MLPHARE имеет возможность вывода карт двойной разности, которые можно использовать
искать дальнейшие тяжелые атомы. В этом случае программа PEAKMAX также будет запущена для
перечислить пики в файл PDB и в файл высокой доступности с именем project_jobid_label_peaks.ha
где метка — метка столбца MTZ производной FPH.Если ты хочешь заняться другим
анализа на карте, его можно ввести в задачу «Создать карту Паттерсона», когда
Параметр «Выполнить БПФ …» в верхней части окна задачи отключен.

Проще всего создавать карты, выполняя задачу FFT внутри задачи Run Mlphare. Сделай это
включив параметр «Создавать файлы карт с двойной разницей . ..».

В некоторых случаях может потребоваться (повторно) создать карты независимо от
Задача MLPHARE. Это невозможно сделать с помощью задачи «Создание карт для конкретных задач».
в модуле Map & Mask Utilities.И только если вы точно знаете, что делаете
если вы попытаетесь сделать это через Run
БПФ — задача создания карты в модуле «Утилиты карт и масок».

См. Документацию по программе:
MLPHARE,
ПИКМАКС,
БПФ.

См. Также
MIRTutorial (Ванна)
(HTML-эквивалент $ CDOC / Iso_repl_itickle_tut.bath.ps),
Изоморфное замещение (Биркбек),
LLNL — Кристаллографические веб-апплеты Бернхарда Руппа
(содержащий апплет, который вычисляет ожидаемые коэффициенты аномальной дисперсии),
Chooch (программа для расчета аномальных факторов рассеяния по рентгеновской флуоресценции.
данные).

Набор программ CCP4: mlphare

Программный пакет CCP4: mlphare

НАЗВАНИЕ

мл фазы
— уточнение тяжелого атома максимальной вероятности и расчет фазы

ОБЗОР

mlphare hklin foo. mtz hklout foo_out.mtz
newparm foo_out.com [ xyzout foo.brk ]
[ввод по ключевому слову]

ОПИСАНИЕ

Эта программа уточнит параметры тяжелых атомов и оценки ошибок, затем
используйте эти уточненные параметры для получения информации о фазе.Максимум
количество тяжелых атомов, которые могут быть очищены, составляет 130 по максимуму 20 производным.
Программа изначально написана для МИР, но также может использоваться для фазирования
из данных MAD, где разные длины волн интерпретируются как разные
«деривативы».

Осторожно: эта программа принципиально отличается от старого PHARE, даже
хотя часть кода кажется знакомой. Включение концепций
максимального правдоподобия означает, что уточнение параметров намного больше
надежный, и создание фаз и показателей качества более реалистично.См. ПРИМЕЧАНИЯ ПО ИСПОЛЬЗОВАНИЮ.

Примечание: параметры тяжелого атома также могут быть уточнены в векторном пространстве с помощью
программа VECREF.

Ссылка: З. Отвиновски: Материалы по выходным в Дарсбери, 1991 г.

ВВОД КЛЮЧЕВОГО СЛОВА

Ключевые слова делятся на два набора.

Набор 1: общие ключевые слова

Эти ключевые слова управляют вычислением. Обязательные ключевые слова:

        ЛАБОРАТОРИЯ 
        ЦИКЛ  или  ФАЗА 
        LABOUT  - необходимо, если вы хотите вывести файл HKLOUT. END  - для обозначения конца ввода; если более одного
            производная, ключевое слово DERIV
            обозначает конец ввода для предыдущей производной.
 

Необязательные ключевые слова:

УГОЛ , ПРИМЕНИТЬ ,
CENTRIC , COORDS ,
ИСКЛЮЧИТЬ , ПРОПУСТИТЬ ,
FHOUT ,
HLOUT , PRINT ,
РАЗРЕШЕНИЕ , МАСШТАБ ,
СКРИПТ , ПОРОГ ,
НАЗВАНИЕ

Кроме того, следующие необязательные ключевые слова управляют сбором данных.
функциональность:

PNAME , DNAME ,
ЧАСТНАЯ , USECWD ,
RSIZE , NOHARVEST

Набор 2: производные ключевые слова, которые ДОЛЖНЫ следовать за приведенным выше списком

Они повторяются один раз для каждой производной.

Обязательные ключевые слова:

ATOM , ATREF ,
DCYCLE , ПРОИЗВОДНАЯ

Необязательные ключевые слова:

ANOERROR , ИСКЛЮЧАЯ ,
ISOERROR , РАЗРЕШЕНИЕ ,
МАСШТАБ , ВОЛНА

Набор 1: общие ключевые слова

ЦИКЛ

[
…..]

устанавливает количество циклов, которые программа будет запускать (по умолчанию
10).Первые ( -1) циклы используются для уточнения
параметры тяжелого атома и оценки погрешности. Фазы для ВСЕХ отражений
в файле до внешнего предела разрешения рассчитываются на последнем цикле.
Статистику можно собирать как для последнего цикла уточнения, так и для
фазовый цикл.

… — флаги для вычисляемых извне
фазы и должны быть установлены только в том случае, если вы хотите их использовать. В общем доработка
процедура определяет вероятное взвешивание всех возможных белковых фаз
выборка по фазовой окружности и использование этой информации для поэтапного
уточнение.Любой конкретный вклад в производные финансовые инструменты будет контролироваться
параметры в строке ввода DCYCLE.

Если вы хотите ввести фазы, рассчитанные где-то еще, и использовать их для уточнения
для некоторых циклов укажите здесь номера этих циклов. Например. :
CYCLE 10 2 3 5 7 9
будет означать, что будет выполнено 10 циклов, 9 — для уточнения и заключительного фазирования.
цикл, и что внешние фазы будут использоваться во время уточнения циклов
2, 3, 5, 7 и 9. Если эти флаги установлены, вы должны назначить столбец для PHIC,
и для WC или FC.См. ПРИМЕЧАНИЯ К PHIC, чтобы узнать, как они
использовал. Вклад может быть добавлен к фазовому правдоподобию, рассчитанному из
производные в пользу внешней фазы или ее можно использовать отдельно.

ФАЗА

Это ключевое слово сигнализирует, что нужно ТОЛЬКО рассчитывать фазы, а не
делать какие-то доработки. Это эквивалент ЦИКЛА 1. Фазы для ВСЕХ отражений.
в файле до предела внешнего разрешения.

LABIN

<метка программы> = <метка файла>
…..

Связывает метки столбцов, ожидаемые программой, с метками столбцов.
во входном файле.Могут быть назначены следующие <метки программы>:

        FP SIGFP
        FPh2 SIGFPh2 DPh2 SIGDPh2
        FPh3 SIGFPh3 DPh3 SIGDPh3
        ФПх4 СИГФПх4 ДФх4 СИГДПх4
        ФПх5 СИГФПх5 ДПх5 СИГДПх5
        FPH5 SIGFPH5 DPH5 SIGDPH5
        .
        .
        .
        ФПх30 СИГФПх30 ДФх30 СИГДПх30
        FC PHIC WC
        F0 F1 F2 F3 ..F19
 

Где:

H, K, L

FP

Родной F

SIGFP

сигма (FP)

Тогда для каждой производной (i = производное число)

FPHi

Производная F

SIGFPHi

сигма (FPHi)

[DPHi]

Аномальная разница (если используются аномальные данные)

[SIGDPHi]

сигма (DELi)

Для фаз с внешним расчетом

PHIC

Фазы, которые будут использоваться при уточнении. Это необходимо, только если
установлены флаги. См. Ключевое слово CYCLE.

[WC]

Вес для этих фаз. По умолчанию 1.0.

[FC]

Значение Fcalc. Используется для оценки веса симулятора для рассчитанных фаз.

F0 F1 .. Назначения для выбранных дополнительных столбцов, которые будут скопированы в
выходной файл. NB F0, F1 и т. Д. Не следует назначать, если
LABOUT ALLIN также используется.

Назначения необходимы для FP, SIGFP и как минимум одной производной
(ФПх2, СИГФФ2).Количество производных выводится из назначений FPHi.

Если вы хотите скопировать все столбцы из входного файла в выходной, укажите ALLIN
в строке LABOUT. Если вы хотите скопировать выбранные столбцы из ввода в
выходной файл, вы можете назначить до 19 столбцов, используя F0 F1 … F19

ЛАБОРАТОРИЯ [АЛЛИН | [

<метка программы> = <файл label> …]]

Связывает метки столбцов в выходном файле с метками, используемыми
программа.

Указание ALLIN копирует все входные столбцы в выходные. NB , если АЛЛИН
указано, то LABIN F0 = … F1 = … etc должен
не использоваться.

Могут быть назначены следующие дополнительные метки.

 ФИБ ФОМ
        HLA HLB HLC HLD
        Fh2 PHIh2 FHA1 PHIHA1
        Fh3 PHIh3 FHA2 PHIHA2
        .....
        Fh30 PHIh30 FHA20 PHIHA20
 

где

PHIB

фаза максимального правдоподобия

ФОМ

добротность

HLA, HLB, HLC, HLD

Коэффициенты Хендриксона-Латтмана выводятся, если HLOUT запрашивает

FHi PHIHi FHAi PHIHAi

дают реальные и мнимые структурные факторы тяжелого атома.Вывод, если
FHOUT запрашивается для этой производной (FPHi SIGFPHi [DPHi SIGDPHi
] также будет скопирован в выходной файл). Эта информация нужна, если
вы хотите сделать двойную разность Фурье, чтобы найти более тяжелые атомные узлы.
См. Документацию по БПФ.

FP SIGFP PHIB и FOM

Всегда выводятся

.

Следующие данные копируются из входного файла, если они были назначены.

 FC PHIC WC
        F0 F1 F2 F3..F11
 

Если указан параметр LABOUT, программа выводит файл, назначенный HKLOUT.
содержащий как минимум H K L FP SIGFP PHIB FOM и другие дополнительные столбцы
ДЛЯ ВСЕХ ОТРАЖЕНИЙ к внешнему разрешению обрезал. ЕСЛИ LABOUT НЕ указан
у вас нет выходного файла.

Для определенных задач удобно назначать FP и FPHi одному и тому же
столбец.

Необязательные ключевые слова:

УГОЛ

<угол>

— интервал углов в градусах для расчета
кривая фазовой вероятности (по умолчанию 10).

N.B. : Скорость программы пропорциональна 360 / . ZO рекомендует
= 20, кроме случаев, когда производная имеет высокую фазовую мощность, тогда
= 10. EJD всегда использует = 10 — время не так ценно …

ПРИМЕНИТЬ

Применяются окончательная общая шкала и значения B для каждой производной
в FPHi, SIGFPHi, DPHi, SIGDPHi до того, как они будут записаны в HKLOUT. В
по умолчанию просто выводятся введенные столбцы.

CENTRIC

Это ограничивает программу использованием только центральных отражений для уточнения.Это разумно, если у вас достаточно центральных данных. В общем есть
гораздо больше наблюдений, чем параметры тяжелого атома, требующие уточнения, и
координаты и относительное реальное заселение часто можно точно уточнить
только на основе центральных данных. Однако вам придется использовать ацентрические данные для уточнения
аномальная занятость. В этом случае целесообразно уточнить координаты
и реальные занятости по сравнению с центрическими данными в первую очередь и включают ацентрические данные
во втором прогоне.

ПРОПУСТИТЬ

Программа использует только каждое отражение «Icycle + nskip-th» для уточнения.Это экономит много времени. Набор отражений меняется с каждым циклом. Финал
Цикл фазирования использует все отражения.

ИСКЛЮЧИТЬ [SIGFP

]

Если за SIGFP следует число , отражения исключаются
если FP Для каждой производной приведены другие ИСКЛЮЧИТЕЛЬНЫЕ тесты.
в очереди.

FHOUT [DERIV]

…

… укажите производные числа, для которых вы хотите
Вывод FHi PHIHi [FHAi PHIHAi] готов для карт двойной разности.

HLOUT

Вызывает вывод коэффициентов Хендриксона-Латтмана.
Метки по умолчанию HLA HLB HLC HLD

ПЕЧАТЬ [СТАТИСТИКА] [AVF] [AVE] …. [NOSTATS] [MON

]
[COR]

Вспомогательные ключевые слова управляют типом вывода. По умолчанию выводится
статистика только для последнего цикла. Статистика уточнения включает только
отражения, используемые для прохода УТОЧНЕНИЯ
для этой производной. Окончательная статистика будет включать информацию обо всех отражениях.
Если вы выполняете только фазирование, например, после смены руки, статистика не выводится.

Возможные ключевые слова:

СТАТИСТИКА

статистических вывода и xloggraphs для последнего цикла уточнения и заключительного цикла фазирования.

НОСТАТЫ

нет статистики.

MON

Установите это, если хотите отслеживать каждое -ое отражение.
По умолчанию — каждое 10-е отражение.

COR

Выходная корреляционная матрица (по умолчанию: нет)

Ключевые слова для управления типом статистического анализа.

     «СТАРЫЙ ВЕС (W1)» определяется как:
     W1 = (Phase Prob всех фаз) / (SIG (Fph) ** 2 + VCALC + IsoError ** 2 (resn))
 где VCALC = SIGFP ** 2 * ((FPSQ + FPA * FHA + FPB * FHB) / (FP * FPH)) ** 2
     FPA = FP * COS (PhiX) FHA = FH * COS (PhiH)
     FPB = FP * SIN (PhiX) FHB = FH * SIN (PhiH)

     «НОВЫЙ ВЕС (W2)» определяется как:
     W1 = Phase Prob / (SIG (Fph) ** 2 + SIG (Fp) ** 2)

 

AVF

дает невзвешенное среднее значение FP FPH FH

AVE

дает невзвешенные средние условия отсутствия замкнутости.

RMSF

дает невзвешенное среднеквадратичное значение FP FPH FH

RMSE

дает невзвешенные среднеквадратичные условия отсутствия защиты.

W1AVE

дает средневзвешенное значение FP FPH FH, суммированное по фазовому кругу

W2AVE

дает средневзвешенное значение отсутствия_замыкания, суммированное по фазовому кругу

W1RMSE

дает взвешенное среднеквадратичное значение FP FPH FH, суммированное по фазовой окружности

W2RMSE

дает взвешенные среднеквадратичные значения Lack_of_closures, суммированные по фазовому кругу

Есть некоторые споры о том, какой тип статистики является наиболее полезным.EJD использует AVE и AVF. Важно использовать только ОДИН вариант, иначе
вы завалены информацией и придерживайтесь этого варианта. Оценивать
вносят ли новые сайты вклад EJD, ищет ли Cullis
R-факторы по мере добавления новых сайтов. См. Примечания по использованию для получения подсказок по
эта информация.

РАЗРЕШЕНИЕ [

]

Общий диапазон разрешения для всех уточнений и фазирования в Ангстремах
(или как 4sin (theta) ** 2 / lambda ** 2 limit, если оба они <1. 0). Если бы только один
дается предел, это верхний предел; в противном случае пределы могут быть в любом
порядок. По умолчанию используется разрешение из файла MTZ. Данные для
деривативы могут быть ограничены дополнительным ключевым словом RESOLUTION после
ПРОИЗВОДНЫЕ определения.

SCALE SIGFP

<шкала>

Определяет масштабный коэффициент, на который умножается SIGFP. По умолчанию
<масштаб> = 1.

ПОРОГ